More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0634 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0634  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0820707  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0770  transcription antitermination protein NusB  76.06 
 
 		 171 aa  225  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0763  transcription antitermination protein NusB  76.06 
 
 		 171 aa  225  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2525  transcription antitermination protein NusB  74.65 
 
 		 168 aa  222  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0822  transcription antitermination protein NusB  66.67 
 
 		 160 aa  213  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.932634  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1620  transcription antitermination protein NusB  64.52 
 
 		 160 aa  209  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1280  transcription antitermination protein NusB  67.13 
 
 		 160 aa  205  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1191  transcription antitermination protein NusB  67.13 
 
 		 160 aa  205  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1139  transcription antitermination protein NusB  63.52 
 
 		 167 aa  193  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2639  transcription antitermination protein NusB  57.04 
 
 		 169 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.093311  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2676  transcription antitermination protein NusB  55.94 
 
 		 174 aa  173  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0143299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3009  transcription antitermination protein NusB  55.94 
 
 		 174 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1819  transcription antitermination protein NusB  56.64 
 
 		 160 aa  168  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4644  transcription antitermination protein NusB  56.64 
 
 		 169 aa  167  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187095  normal  0.435075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2664  transcription antitermination protein NusB  55.24 
 
 		 169 aa  167  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0957434  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1722  transcription antitermination protein NusB  52.6 
 
 		 161 aa  163  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.0484184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3979  NusB antitermination factor  47.37 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000171022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0659  NusB antitermination factor  53.15 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0207  NusB antitermination factor  50.7 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0827539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4281  NusB antitermination factor  43.79 
 
 		 163 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.996449  normal  0.0149277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6801  NusB antitermination factor  49.3 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7540  NusB antitermination factor  49.3 
 
 		 156 aa  140  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00424485  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3161  transcription antitermination factor NusB  43.59 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.143808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3485  NusB antitermination factor  43.59 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.982514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3357  NusB antitermination factor  46.15 
 
 		 172 aa  137  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0755  NusB antitermination factor  46.1 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2412  NusB antitermination factor  46.1 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1531  transcription antitermination protein NusB  44.03 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0468647  normal  0.834868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2914  NusB antitermination factor  51.09 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00764902  hitchhiker  0.00305914 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0422  NusB antitermination factor  44.68 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2025  NusB antitermination factor  42.96 
 
 		 149 aa  123  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0100858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3044  transcription antitermination protein NusB  42.47 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2127  NusB antitermination factor  42.55 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2249  N utilization substance protein B-like protein  41.18 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.561904 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3412  NusB antitermination factor  41.13 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.45885  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2921  NusB antitermination factor  42.75 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3536  NusB antitermination factor  40 
 
 		 183 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2775  NusB antitermination factor  40.46 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1821  NusB antitermination factor  35.85 
 
 		 185 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1553  NusB antitermination factor  39.13 
 
 		 166 aa  90.9  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0479521 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2117  NusB antitermination factor  34.69 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4049  NusB antitermination factor  36.73 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1680  NusB antitermination factor  34.27 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.429573  normal  0.936323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4458  transcription antitermination protein NusB  35.46 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11450  transcription antitermination protein NusB  36.88 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0546593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1049  transcription antitermination protein NusB  36.88 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0571  transcription antitermination protein NusB  35.62 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0694  N utilization substance protein B  35.46 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  34.07 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5015  transcription antitermination protein NusB  34.93 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0803  NusB antitermination factor  33.1 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0518  transcription antitermination protein NusB  36.3 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.360149  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0564  transcription antitermination protein NusB  36.3 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0553  transcription antitermination protein NusB  36.3 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3853  transcription antitermination protein NusB  35.86 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1563  NusB antitermination factor  34.48 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0896  NusB antitermination factor  36.03 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.361769  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  33.1 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0846  NusB antitermination factor  34.29 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.423141  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  32.86 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  35.04 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  35.92 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  32.85 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  32.85 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0926  transcription antitermination protein NusB  33.56 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  32.85 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  32.85 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  32.85 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06760  transcription antitermination protein NusB  35.04 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  32.85 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  30.2 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1027  transcription antitermination protein NusB  32.09 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  33.83 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  28.26 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  28.26 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1100  transcription antitermination protein NusB  32.85 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000596608  normal  0.728168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1166  transcription antitermination protein NusB  32.85 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00313304  normal  0.241653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1100  transcription antitermination protein NusB  32.85 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000020777  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1857  transcription antitermination protein NusB  31.51 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0201856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  33.58 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1865  NusB antitermination factor  36.88 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  32.37 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2582  NusB antitermination factor  32.48 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3283  transcription antitermination protein NusB  32.09 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0603  transcription antitermination protein NusB  32.17 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.016248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2897  transcription antitermination protein NusB  32.09 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3454  transcription antitermination protein NusB  33.57 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262306 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  31.69 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  31.85 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>