192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3412 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3412  NusB antitermination factor  100 
 
 		 165 aa  336  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.45885  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2412  NusB antitermination factor  74.83 
 
 		 157 aa  239  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0755  NusB antitermination factor  75.84 
 
 		 155 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0422  NusB antitermination factor  75.17 
 
 		 157 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2127  NusB antitermination factor  74.21 
 
 		 160 aa  231  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2249  N utilization substance protein B-like protein  74.32 
 
 		 159 aa  221  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.561904 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1553  NusB antitermination factor  66.67 
 
 		 166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0479521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4281  NusB antitermination factor  43.37 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.996449  normal  0.0149277 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2664  transcription antitermination protein NusB  42.86 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0957434  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2639  transcription antitermination protein NusB  41.92 
 
 		 169 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.093311  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0207  NusB antitermination factor  44.9 
 
 		 155 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0827539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1819  transcription antitermination protein NusB  44.37 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1531  transcription antitermination protein NusB  46.38 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0468647  normal  0.834868 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0659  NusB antitermination factor  46.21 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_004310  BR0770  transcription antitermination protein NusB  40.99 
 
 		 171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0763  transcription antitermination protein NusB  40.99 
 
 		 171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2676  transcription antitermination protein NusB  40.99 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0143299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2525  transcription antitermination protein NusB  39.61 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6801  NusB antitermination factor  46.15 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4644  transcription antitermination protein NusB  41.1 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187095  normal  0.435075 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3536  NusB antitermination factor  42.67 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1620  transcription antitermination protein NusB  41.03 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1139  transcription antitermination protein NusB  43.75 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7540  NusB antitermination factor  44.76 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00424485  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1722  transcription antitermination protein NusB  43.14 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.0484184 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3044  transcription antitermination protein NusB  41.45 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0822  transcription antitermination protein NusB  39.74 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.932634  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3009  transcription antitermination protein NusB  40.99 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0634  transcription antitermination protein NusB  41.13 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0820707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2117  NusB antitermination factor  43.92 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2025  NusB antitermination factor  38.26 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0100858 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1280  transcription antitermination protein NusB  39.58 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1191  transcription antitermination protein NusB  39.16 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1821  NusB antitermination factor  39.2 
 
 		 185 aa  98.6  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3979  NusB antitermination factor  38.75 
 
 		 197 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000171022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3357  NusB antitermination factor  38.93 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3485  NusB antitermination factor  38.93 
 
 		 171 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.982514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3161  transcription antitermination factor NusB  38.93 
 
 		 171 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.143808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2914  NusB antitermination factor  41.18 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00764902  hitchhiker  0.00305914 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2921  NusB antitermination factor  36.43 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2775  NusB antitermination factor  34.88 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4049  NusB antitermination factor  28.99 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3454  transcription antitermination protein NusB  32.12 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262306 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1166  transcription antitermination protein NusB  31.91 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000379162  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  36.89 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5015  transcription antitermination protein NusB  32.48 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  32.12 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  32.19 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0784  putative N utilization substance protein B  22.92 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  32.26 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  31.91 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  31.39 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  31.51 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1680  NusB antitermination factor  31.43 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.429573  normal  0.936323 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf181  transcription termination factor  34.52 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.227846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11450  transcription antitermination protein NusB  31.91 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0546593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1049  transcription antitermination protein NusB  31.91 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0579  transcription antitermination protein NusB  27.88 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1444  NusB antitermination factor  31.21 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  31.39 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  28.15 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1315  transcription antitermination protein NusB  32.84 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0846  NusB antitermination factor  29.38 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.423141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  30.66 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  34.03 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  30.66 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  30.66 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  30.66 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  30.66 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  29.79 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  29.79 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  29.79 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  25.17 
 
 		 135 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  33.1 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  35.64 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3853  transcription antitermination protein NusB  30.57 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2442  transcription antitermination protein NusB  32.45 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  30.88 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004261  transcription termination protein NusB  30.82 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00012061  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1578  transcription antitermination protein NusB  29.66 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000076307  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  31.16 
 
 		 133 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1100  transcription antitermination protein NusB  30.71 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000596608  normal  0.728168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1166  transcription antitermination protein NusB  30.71 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00313304  normal  0.241653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1100  transcription antitermination protein NusB  30.71 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000020777  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0896  NusB antitermination factor  30.66 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.361769  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  30.94 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  27.4 
 
 		 140 aa  51.2  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01170  transcription antitermination protein NusB  30.82 
 
 		 155 aa  50.8  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  29.66 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1563  NusB antitermination factor  28.21 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2147  transcription antitermination protein NusB  29.25 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4056  transcription antitermination protein NusB  30.46 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1529  transcription antitermination protein NusB  29.25 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0762  transcription antitermination protein NusB  29.25 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2595  transcription antitermination protein NusB  29.25 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.694144  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3018  transcription antitermination protein NusB  29.25 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3071  transcription antitermination protein NusB  29.25 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2018  transcription antitermination protein NusB  29.25 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.415369  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0291  hypothetical protein  26.17 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>