More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3044 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3044  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 153 aa  306  9e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1531  transcription antitermination protein NusB  55.47 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0468647  normal  0.834868 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2025  NusB antitermination factor  50 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0100858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2664  transcription antitermination protein NusB  48.95 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0957434  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2676  transcription antitermination protein NusB  47.55 
 
 		 174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0143299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0822  transcription antitermination protein NusB  44.9 
 
 		 160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.932634  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1819  transcription antitermination protein NusB  48.95 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2639  transcription antitermination protein NusB  45.75 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.093311  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2914  NusB antitermination factor  49.64 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00764902  hitchhiker  0.00305914 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1620  transcription antitermination protein NusB  44.76 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1722  transcription antitermination protein NusB  47.22 
 
 		 161 aa  123  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.0484184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2775  NusB antitermination factor  49.62 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3979  NusB antitermination factor  46.26 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000171022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4644  transcription antitermination protein NusB  44.76 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187095  normal  0.435075 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0634  transcription antitermination protein NusB  42.47 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0820707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3009  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 		 174 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2525  transcription antitermination protein NusB  46.76 
 
 		 168 aa  120  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0770  transcription antitermination protein NusB  46.76 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0763  transcription antitermination protein NusB  46.76 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0207  NusB antitermination factor  44.14 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0827539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6801  NusB antitermination factor  46.15 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7540  NusB antitermination factor  46.15 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00424485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1191  transcription antitermination protein NusB  44.06 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1280  transcription antitermination protein NusB  44.06 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0659  NusB antitermination factor  45.45 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2127  NusB antitermination factor  42.28 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3485  NusB antitermination factor  45.83 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.982514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3161  transcription antitermination factor NusB  45.83 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.143808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3357  NusB antitermination factor  43.75 
 
 		 172 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4281  NusB antitermination factor  40.52 
 
 		 163 aa  113  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.996449  normal  0.0149277 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0755  NusB antitermination factor  41.72 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2412  NusB antitermination factor  41.72 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0422  NusB antitermination factor  41.72 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3412  NusB antitermination factor  41.45 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.45885  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2249  N utilization substance protein B-like protein  41.1 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.561904 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1139  transcription antitermination protein NusB  43.06 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3536  NusB antitermination factor  40.27 
 
 		 183 aa  103  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2921  NusB antitermination factor  42.75 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2117  NusB antitermination factor  36.84 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1553  NusB antitermination factor  41.01 
 
 		 166 aa  96.7  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0479521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1821  NusB antitermination factor  39.35 
 
 		 185 aa  90.5  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2582  NusB antitermination factor  37.16 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  34.29 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3454  transcription antitermination protein NusB  36.69 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262306 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  33.57 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  33.57 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  34.04 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  32.61 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0803  NusB antitermination factor  35.86 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4049  NusB antitermination factor  35.37 
 
 		 174 aa  77  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  35.51 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  43.18 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  35.51 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  31.21 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0694  N utilization substance protein B  35.25 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  34.53 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  36.73 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  34.53 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  37.61 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4458  transcription antitermination protein NusB  35.25 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  33.79 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0579  transcription antitermination protein NusB  34.01 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  37.24 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  34.78 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  34.78 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  34.78 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  34.78 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  34.78 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  34.78 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  34.06 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  32.87 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  40.2 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0584  transcription antitermination protein NusB  38.31 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1578  transcription antitermination protein NusB  33.78 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000076307  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  38.03 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  37.06 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04396  transcription antitermination protein NusB  39.42 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371265  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  34.53 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  34.53 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  36.43 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  34.53 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  31.29 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  43.02 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  34.13 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  31.25 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  35.66 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  32.17 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  31.08 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  35.71 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1444  NusB antitermination factor  31.51 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  34.46 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1680  NusB antitermination factor  35.66 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.429573  normal  0.936323 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  30.99 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  37.04 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  36.43 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  32.86 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0518  transcription antitermination protein NusB  37.41 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.360149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0553  transcription antitermination protein NusB  37.41 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  35.56 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  35.56 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>