102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf181 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf181  transcription termination factor  100 
 
 		 148 aa  298  2e-80  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.227846  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0058  N utilization substance protein B (nusB), putative  38.89 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0422  NusB antitermination factor  42.86 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0755  NusB antitermination factor  43.28 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3412  NusB antitermination factor  34.52 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.45885  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2412  NusB antitermination factor  43.28 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2249  N utilization substance protein B-like protein  41.79 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.561904 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl332  transcription termination factor  36.51 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1821  NusB antitermination factor  35.29 
 
 		 185 aa  50.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2127  NusB antitermination factor  38.81 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3044  transcription antitermination protein NusB  27.56 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  25.95 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  30.69 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  39.68 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  42.86 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  33.72 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4281  NusB antitermination factor  25.68 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.996449  normal  0.0149277 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  33.86 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  38.46 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  40.3 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1139  transcription antitermination protein NusB  25.9 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1553  NusB antitermination factor  35.82 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0479521 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  33.02 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1191  transcription antitermination protein NusB  26.49 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  39.68 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4056  transcription antitermination protein NusB  39.66 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1280  transcription antitermination protein NusB  26.49 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0634  transcription antitermination protein NusB  25.87 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0820707  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2442  transcription antitermination protein NusB  42.11 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  31.91 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0476  transcription antitermination protein NusB  40.35 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0816  transcription antitermination protein NusB  40.35 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0955  transcription antitermination protein NusB  40.35 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0822  transcription antitermination protein NusB  28.97 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.932634  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0917  transcription antitermination protein NusB  40.35 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0825  transcription antitermination protein NusB  40.35 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.61519 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  37.5 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  29.71 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0891  transcription antitermination protein NusB  39.66 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  38.33 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  38.03 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  36.92 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6801  NusB antitermination factor  24.48 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3919  transcription antitermination protein NusB  30.69 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174656  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0107  transcription antitermination protein NusB  34.21 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1654  N utilization substance protein B  38.6 
 
 		 198 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00612472  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2147  transcription antitermination protein NusB  38.6 
 
 		 145 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1529  transcription antitermination protein NusB  38.6 
 
 		 145 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0762  transcription antitermination protein NusB  38.6 
 
 		 145 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2595  transcription antitermination protein NusB  38.6 
 
 		 145 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.694144  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3018  transcription antitermination protein NusB  38.6 
 
 		 145 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3071  transcription antitermination protein NusB  38.6 
 
 		 145 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2018  transcription antitermination protein NusB  38.6 
 
 		 145 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.415369  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3103  transcription antitermination protein NusB  39.66 
 
 		 144 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3357  NusB antitermination factor  23.02 
 
 		 172 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  39.34 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  40 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  38.33 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  36.92 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  34.38 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2937  NusB antitermination factor  39.66 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3009  transcription antitermination protein NusB  24.29 
 
 		 174 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  39.34 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  34.15 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3979  NusB antitermination factor  22.67 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000171022 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0422  hypothetical protein  40.91 
 
 		 378 aa  41.2  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  25.58 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  25.58 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1620  transcription antitermination protein NusB  26.43 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  32.31 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0379  NusB antitermination factor  36.21 
 
 		 178 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.442506  normal  0.110028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4644  transcription antitermination protein NusB  37.1 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187095  normal  0.435075 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  35.38 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  26.36 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1396  NusB antitermination factor  42.37 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2639  transcription antitermination protein NusB  32.84 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.093311  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  32.35 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  32.35 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  32.35 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  32.35 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  34.57 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  32.35 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  36.51 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  29.63 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  37.5 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2676  transcription antitermination protein NusB  32.84 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0143299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1531  transcription antitermination protein NusB  28.99 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0468647  normal  0.834868 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  25.58 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0617  transcription antitermination protein NusB  38.6 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  33.73 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  25.58 
 
 		 130 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  25.58 
 
 		 130 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  25.58 
 
 		 130 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  25.58 
 
 		 130 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1100  transcription antitermination protein NusB  32.35 
 
 		 134 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000596608  normal  0.728168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1166  transcription antitermination protein NusB  32.35 
 
 		 134 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00313304  normal  0.241653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1100  transcription antitermination protein NusB  32.35 
 
 		 134 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000020777  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  26.35 
 
 		 163 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 145 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>