74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0880 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0880  putative N utilization substance protein B  100 
 
 		 141 aa  276  6e-74  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.150088  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0784  putative N utilization substance protein B  31.62 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0291  hypothetical protein  33.64 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  27.61 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4281  NusB antitermination factor  25.34 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.996449  normal  0.0149277 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0750  transcription termination factor  29.92 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.906803  hitchhiker  0.00118755 
 
 
-
 
NC_002978  WD0239  N utilization substance protein B, putative  26.39 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  29.25 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2249  N utilization substance protein B-like protein  40 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.561904 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2117  NusB antitermination factor  30.85 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  27.34 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0422  NusB antitermination factor  35.05 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0659  NusB antitermination factor  31.31 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2127  NusB antitermination factor  25.69 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2025  NusB antitermination factor  23.61 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0100858 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2412  NusB antitermination factor  32.99 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0755  NusB antitermination factor  32.99 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1553  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 166 aa  48.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0479521 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3536  NusB antitermination factor  29.79 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0207  NusB antitermination factor  29.03 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0827539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  29.2 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1532  transcription termination/antitermination factor NusB  26.43 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.318402  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1821  NusB antitermination factor  29.29 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  26.72 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  28.28 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_004310  BR0770  transcription antitermination protein NusB  30.67 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0763  transcription antitermination protein NusB  30.67 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2525  transcription antitermination protein NusB  30.67 
 
 		 168 aa  47.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  29.29 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3412  NusB antitermination factor  34.67 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.45885  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0822  transcription antitermination protein NusB  22.76 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.932634  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2914  NusB antitermination factor  35.29 
 
 		 171 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00764902  hitchhiker  0.00305914 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1865  NusB antitermination factor  28.28 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  27.21 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  24.44 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2775  NusB antitermination factor  34.72 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1002  NusB antitermination factor  27.82 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1191  transcription antitermination protein NusB  22.07 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  31.93 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1280  transcription antitermination protein NusB  22.07 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1819  transcription antitermination protein NusB  36.23 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3853  transcription antitermination protein NusB  28.68 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1444  NusB antitermination factor  27.15 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2676  transcription antitermination protein NusB  30.14 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0143299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2639  transcription antitermination protein NusB  30.14 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.093311  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 138 aa  43.9  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2921  NusB antitermination factor  25.71 
 
 		 148 aa  43.5  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  25.4 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3009  transcription antitermination protein NusB  31.88 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  25.87 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  24.63 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2664  transcription antitermination protein NusB  30.14 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0957434  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1139  transcription antitermination protein NusB  25.33 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1166  transcription antitermination protein NusB  25.93 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000379162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4644  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187095  normal  0.435075 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0634  transcription antitermination protein NusB  27.78 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0820707  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  30.43 
 
 		 145 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  30.43 
 
 		 145 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3979  NusB antitermination factor  30.88 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000171022 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  25.26 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  30.77 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0807  NusB family protein  31.82 
 
 		 364 aa  40.8  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1722  transcription antitermination protein NusB  30.14 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.0484184 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  35.38 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1620  transcription antitermination protein NusB  21.68 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  35.38 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  30.77 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  35.38 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3103  transcription antitermination protein NusB  26.62 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2582  NusB antitermination factor  31.25 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  23.45 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004261  transcription termination protein NusB  30.93 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00012061  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  32.1 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0846  NusB antitermination factor  24.64 
 
 		 158 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.423141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>