More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0842 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  679    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  44.27 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  45.55 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  41.77 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  41.46 
 
 		 324 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  41.46 
 
 		 324 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  41.64 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  40.48 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  41.02 
 
 		 326 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  42.02 
 
 		 340 aa  208  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  33.85 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  33.64 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  32.62 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  29.38 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  29.75 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  35.29 
 
 		 356 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  30.79 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  35.03 
 
 		 325 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  35 
 
 		 332 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  35.83 
 
 		 329 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  31.67 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  33.01 
 
 		 320 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  31.99 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  35.81 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  29.03 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  36.36 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  34.66 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  33.21 
 
 		 329 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  36.15 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  31.56 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  30.09 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  35.9 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  32.38 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  34.23 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.6 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3797  extra-cytoplasmic solute receptor  36.25 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  31.63 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  33.69 
 
 		 326 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  32.42 
 
 		 340 aa  152  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  35.46 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  35.25 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  34.52 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  34.07 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  36.17 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  31.53 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  36.12 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  32.58 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4275  hypothetical protein  34.68 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  36.5 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  30.85 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  32.95 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  34.07 
 
 		 329 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  32.96 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  33.98 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1849  hypothetical protein  32.05 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.210601 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  33.57 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  34.73 
 
 		 337 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  33.44 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  36.12 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  33.1 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  33.22 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  34.7 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  30.19 
 
 		 328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  35.12 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  36.63 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0610  hypothetical protein  33.89 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417146  normal  0.0239615 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  32.31 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  33.78 
 
 		 327 aa  146  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.97 
 
 		 331 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  34.24 
 
 		 346 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  33.69 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4197  hypothetical protein  30.57 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504073  normal  0.975042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5795  hypothetical protein  38.02 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0293168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  28.43 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  31.82 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  30.58 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  34.01 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  34.33 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  30.85 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  33.9 
 
 		 420 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  33.22 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0880  hypothetical protein  31.63 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  31.42 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0277  hypothetical protein  34.72 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  34.36 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  34.92 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  31.96 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  32.88 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  33 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  34.28 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2399  hypothetical protein  31.07 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  32 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  34.23 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  31.43 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  35.39 
 
 		 334 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  33.59 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  33.22 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  32.4 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  32.63 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  33.93 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>