More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4263 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  657    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  73.48 
 
 		 331 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  73.78 
 
 		 332 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  68.63 
 
 		 336 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  69.05 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  67.91 
 
 		 331 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  42.77 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  42.32 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  43.05 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  38.46 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  37.79 
 
 		 327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  37.74 
 
 		 323 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  37.42 
 
 		 323 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  39.33 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  37.46 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  37.74 
 
 		 327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  38.41 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  34.95 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  38.91 
 
 		 338 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  40.55 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  33.96 
 
 		 318 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  39.37 
 
 		 320 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5765  hypothetical protein  36.39 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  38.3 
 
 		 321 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  38.91 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  38.84 
 
 		 329 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.86 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  34.48 
 
 		 350 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.1 
 
 		 318 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  37.67 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  36.01 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  37.5 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  38.75 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  33.57 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  39.73 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  36 
 
 		 353 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  36.88 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  38.41 
 
 		 325 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  37.94 
 
 		 325 aa  165  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  35.88 
 
 		 325 aa  165  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  36 
 
 		 328 aa  165  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  33.68 
 
 		 321 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  38.4 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  37.63 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  36.77 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21240  hypothetical protein  36.52 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00058939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0012  hypothetical protein  38.91 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  34.41 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.02 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  35.85 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  37.25 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  34.87 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.86 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  36.54 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4951  extra-cytoplasmic solute receptor  38.06 
 
 		 329 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  37.59 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  38.78 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  35.45 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  32.72 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  34.29 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  35.36 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.49 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  36.98 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  34.84 
 
 		 323 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  35.84 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36.53 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  35.21 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  33.85 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  33.7 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  36.53 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  37.45 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  31.97 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  35.48 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  34.98 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.93 
 
 		 349 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  34.91 
 
 		 321 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  39.75 
 
 		 321 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  33.97 
 
 		 330 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  33.89 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  33.22 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  35.87 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  39.47 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  32.05 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  37.46 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  35.88 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.59 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  35.71 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.59 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  35.47 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  34.36 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  35.56 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  35.06 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  36.65 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  32.62 
 
 		 330 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  34.65 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  33.8 
 
 		 358 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>