More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2514 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  655    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  65.71 
 
 
325 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  54.15 
 
 
330 aa  340  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  52.55 
 
 
335 aa  338  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  52.68 
 
 
330 aa  335  7.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  53.02 
 
 
335 aa  332  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0073  hypothetical protein  47.47 
 
 
334 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3968  hypothetical protein  39.34 
 
 
328 aa  229  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  41.98 
 
 
320 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  34.76 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  34.76 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  34.45 
 
 
324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  34.06 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  31.69 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  30.41 
 
 
326 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0610  hypothetical protein  33.88 
 
 
317 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417146  normal  0.0239615 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  33.23 
 
 
329 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  36.25 
 
 
325 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  31.21 
 
 
333 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  30.98 
 
 
350 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  31.44 
 
 
322 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  30.79 
 
 
356 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  32.62 
 
 
331 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  31.46 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  32.53 
 
 
328 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  31.19 
 
 
325 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  34.71 
 
 
326 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  29.97 
 
 
320 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  33.44 
 
 
337 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  32.03 
 
 
346 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  33.68 
 
 
323 aa  148  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  35.56 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  33.01 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  32.2 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  32.44 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  31.53 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  32.32 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  32.38 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  34.88 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  30.43 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  33.68 
 
 
323 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  33.56 
 
 
358 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  31.79 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  29.84 
 
 
331 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  34.67 
 
 
316 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  30.2 
 
 
335 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  29.72 
 
 
332 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  31.21 
 
 
322 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  28.9 
 
 
336 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  31.71 
 
 
330 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  31.33 
 
 
320 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  32.09 
 
 
334 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  31.58 
 
 
340 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  32.58 
 
 
328 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  33.22 
 
 
321 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  31.45 
 
 
341 aa  143  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  28.28 
 
 
328 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  28.95 
 
 
336 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  28.28 
 
 
328 aa  142  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  29.74 
 
 
331 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2774  hypothetical protein  32.98 
 
 
333 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  33.68 
 
 
331 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  29.62 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  28.09 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  32.4 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  31.29 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  31.34 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  30.82 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  31.75 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  29.6 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  30.98 
 
 
327 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  32.08 
 
 
328 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  30.3 
 
 
315 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  30.6 
 
 
341 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  32.92 
 
 
337 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  30.79 
 
 
355 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  29.97 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  29.3 
 
 
327 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  30.77 
 
 
321 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0012  hypothetical protein  31.67 
 
 
323 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  28.96 
 
 
337 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  30.46 
 
 
325 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  29.65 
 
 
322 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  29.39 
 
 
339 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  29.89 
 
 
340 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1128  putative tricarboxylate transporter, periplasmic ligand binding protein (TctC subunit))  29.72 
 
 
328 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  29.73 
 
 
323 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  31.71 
 
 
330 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  30.23 
 
 
327 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  32.11 
 
 
339 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  29.35 
 
 
330 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  29.63 
 
 
318 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  34.46 
 
 
329 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  33.87 
 
 
327 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  31.33 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  31.84 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  30 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  30.16 
 
 
332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  30 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0231  hypothetical protein  29.93 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>