More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2441 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  637    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  49.29 
 
 		 335 aa  262  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  44.78 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  42.22 
 
 		 335 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  42 
 
 		 330 aa  245  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  42.9 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  40.3 
 
 		 325 aa  235  9e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0073  hypothetical protein  40.92 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3968  hypothetical protein  37.91 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  35.37 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  34.67 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  34.67 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  34.67 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  34.66 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  34.59 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  34.23 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  35.15 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0610  hypothetical protein  39.19 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417146  normal  0.0239615 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  35.78 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  39.75 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  36 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  36.49 
 
 		 315 aa  158  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  34.31 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  33.99 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  32.44 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  34.25 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1257  hypothetical protein  34.4 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3532  hypothetical protein  33.68 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.37 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  33.87 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  34.89 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  32.56 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  29.87 
 
 		 333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  31.38 
 
 		 338 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  34.27 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1408  hypothetical protein  35.07 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  34.41 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  32.92 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  31.96 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  32.73 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  35.38 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  32.3 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  31.46 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  35.31 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  32.67 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  33.92 
 
 		 321 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5962  hypothetical protein  33.33 
 
 		 322 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  33.23 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  31.69 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  31.1 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5298  hypothetical protein  35.05 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  33.23 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  33.22 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4085  hypothetical protein  34.25 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  32.63 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  30.06 
 
 		 356 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  32.89 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  32 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  31.8 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  33.23 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  34.93 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  33.46 
 
 		 324 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2774  hypothetical protein  34.08 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  32.21 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  35.71 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  31.99 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  33.23 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  33.1 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  31.36 
 
 		 334 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  31.15 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  34.93 
 
 		 324 aa  142  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  34.98 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  35.14 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  35.47 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  34.59 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  31.06 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  34.97 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  32.13 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  33.11 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  31.91 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  34.63 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  31.06 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4309  hypothetical protein  29.56 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2769  hypothetical protein  34.83 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  34.56 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  32.89 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  32.62 
 
 		 355 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  31.87 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  33.56 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4218  hypothetical protein  34.88 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  34.74 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  30.26 
 
 		 332 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  32.75 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  35.64 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  33 
 
 		 322 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  32.54 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  31.34 
 
 		 331 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1347  hypothetical protein  34.74 
 
 		 327 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44147  normal  0.036943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  29.7 
 
 		 329 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  30.28 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>