More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0498 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  646    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  33.8 
 
 
324 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  33.8 
 
 
324 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  33.8 
 
 
324 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  35.74 
 
 
326 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  32.41 
 
 
318 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  33.07 
 
 
335 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  33.33 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  32.5 
 
 
326 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  29.75 
 
 
351 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  32.17 
 
 
325 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  32.86 
 
 
350 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  34.14 
 
 
333 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  32.62 
 
 
326 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  33.11 
 
 
322 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  32.29 
 
 
324 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  36.51 
 
 
325 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  34.59 
 
 
327 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  34.3 
 
 
332 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  32.49 
 
 
333 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  31.89 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  31.49 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  31.85 
 
 
333 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  31.49 
 
 
323 aa  155  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  31.4 
 
 
320 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  34.46 
 
 
335 aa  155  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  33.85 
 
 
333 aa  155  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  32.53 
 
 
316 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  32.53 
 
 
316 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  36.08 
 
 
326 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  32.72 
 
 
327 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  32.47 
 
 
316 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  29.28 
 
 
332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3968  hypothetical protein  32.63 
 
 
328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  33.33 
 
 
330 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  32.42 
 
 
320 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  28.05 
 
 
330 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  33.71 
 
 
335 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  32.96 
 
 
330 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  30.5 
 
 
318 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3055  hypothetical protein  31.34 
 
 
317 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150263  normal  0.0186232 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  30.74 
 
 
326 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  31.67 
 
 
314 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  30.82 
 
 
337 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  32.7 
 
 
698 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  29.73 
 
 
334 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  32.6 
 
 
331 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  33.79 
 
 
320 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3410  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  31.34 
 
 
317 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.523204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  33.21 
 
 
321 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  30.07 
 
 
333 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  32.59 
 
 
330 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0906  hypothetical protein  31.16 
 
 
328 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  32.58 
 
 
335 aa  149  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  33.21 
 
 
330 aa  149  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  31.02 
 
 
321 aa  148  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  32.04 
 
 
343 aa  148  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  32.96 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  31.49 
 
 
331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  29.05 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  30 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  31.19 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  32.38 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  33.81 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  34.08 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  29.03 
 
 
331 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  30.29 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  28.98 
 
 
383 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  29.79 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  31.14 
 
 
331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  31.85 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  28.86 
 
 
326 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  146  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  30.31 
 
 
332 aa  146  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  31.62 
 
 
336 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  29.41 
 
 
332 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  30.32 
 
 
328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  31.38 
 
 
322 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  31.95 
 
 
326 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  28.67 
 
 
330 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  28.94 
 
 
337 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  31 
 
 
330 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  28.26 
 
 
328 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0210  hypothetical protein  32.7 
 
 
322 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  32.04 
 
 
320 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4109  extra-cytoplasmic solute receptor  31.21 
 
 
334 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305056  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  30.34 
 
 
317 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  33.7 
 
 
316 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  32 
 
 
328 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  30.28 
 
 
327 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  30.56 
 
 
328 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  32.08 
 
 
326 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  31.21 
 
 
321 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  29.66 
 
 
328 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  31 
 
 
328 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  30.34 
 
 
317 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  30.2 
 
 
341 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  31.65 
 
 
333 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4640  hypothetical protein  30.98 
 
 
318 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  28.52 
 
 
321 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>