More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2083 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  674    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  85.37 
 
 
331 aa  571  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  80.62 
 
 
336 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  73.78 
 
 
324 aa  478  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  75 
 
 
331 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  75.33 
 
 
339 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  46.89 
 
 
328 aa  295  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  46.74 
 
 
324 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  46.92 
 
 
326 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  43.3 
 
 
327 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  42.61 
 
 
327 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  43.84 
 
 
315 aa  271  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  41.92 
 
 
323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  41.58 
 
 
323 aa  265  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  39.06 
 
 
335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  39.26 
 
 
377 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 
325 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  43.03 
 
 
331 aa  235  9e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  41.24 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  38.44 
 
 
333 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  37.42 
 
 
327 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  34.69 
 
 
318 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5765  hypothetical protein  38.57 
 
 
326 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  41.44 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  33.03 
 
 
383 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  43.12 
 
 
320 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  42.66 
 
 
329 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  40 
 
 
321 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  38.43 
 
 
325 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  38.49 
 
 
327 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  39.35 
 
 
325 aa  176  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41.18 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  37.64 
 
 
326 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.3 
 
 
328 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  38.41 
 
 
325 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  34.59 
 
 
327 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  37.07 
 
 
321 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  38.95 
 
 
321 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  39.31 
 
 
342 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  37.64 
 
 
325 aa  169  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  37.5 
 
 
324 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  35.06 
 
 
326 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  39.53 
 
 
325 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  38.58 
 
 
336 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  38.66 
 
 
333 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  38.76 
 
 
325 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  39.15 
 
 
325 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  36 
 
 
330 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  38.65 
 
 
324 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  36.4 
 
 
323 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  35.34 
 
 
338 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  35.81 
 
 
358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  35.09 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  38.06 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  38.14 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.49 
 
 
326 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  36.59 
 
 
326 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.33 
 
 
349 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  34.05 
 
 
322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  37.54 
 
 
334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  34.56 
 
 
353 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  37.98 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  37.5 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  34.37 
 
 
332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0620  hypothetical protein  38.95 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  33.64 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  34.56 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  39.83 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.79 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  40.86 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.77 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  40.38 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.11 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3173  hypothetical protein  39.58 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0277  hypothetical protein  39.55 
 
 
332 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.37 
 
 
331 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.17 
 
 
324 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.11 
 
 
322 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  36.77 
 
 
323 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  36.47 
 
 
355 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  36.43 
 
 
325 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  35.96 
 
 
332 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  37.02 
 
 
330 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  34.47 
 
 
330 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  38.41 
 
 
325 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.41 
 
 
325 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  33.94 
 
 
336 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  34.19 
 
 
319 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  32.98 
 
 
332 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  33.74 
 
 
330 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0125  hypothetical protein  35.41 
 
 
324 aa  159  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  38.52 
 
 
334 aa  159  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.25 
 
 
318 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  39.15 
 
 
322 aa  159  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  40.47 
 
 
324 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  35.23 
 
 
332 aa  159  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  36.67 
 
 
331 aa  159  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.07 
 
 
328 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  37.54 
 
 
330 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37 
 
 
321 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>