More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3532 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3532  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  690    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  76.02 
 
 		 338 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3823  hypothetical protein  61.2 
 
 		 330 aa  364  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363673  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0889  hypothetical protein  57.98 
 
 		 328 aa  352  5e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.07 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.03 
 
 		 330 aa  265  8e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  43.37 
 
 		 325 aa  261  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.24 
 
 		 333 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.12 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  42.76 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.13 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  41.41 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.54 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.49 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  42.52 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.83 
 
 		 331 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  39.24 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.06 
 
 		 318 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.63 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.93 
 
 		 330 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.24 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  40.79 
 
 		 305 aa  245  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  41.28 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.72 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  43.29 
 
 		 338 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  39.27 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.53 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  40.6 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.53 
 
 		 345 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.53 
 
 		 345 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41.25 
 
 		 336 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.66 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.99 
 
 		 335 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  44.55 
 
 		 333 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.16 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.94 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  37.19 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  40.4 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  43.46 
 
 		 314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  40.13 
 
 		 330 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.2 
 
 		 314 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.96 
 
 		 328 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1429  hypothetical protein  43.85 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  39.14 
 
 		 328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  39.16 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.52 
 
 		 324 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  38.33 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.47 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  41 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  40.07 
 
 		 321 aa  232  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  40.07 
 
 		 324 aa  232  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  38.98 
 
 		 343 aa  232  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.09 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  39.32 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.2 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.4 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  42.27 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  39.5 
 
 		 322 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  41.45 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  42.67 
 
 		 333 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  40.5 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.17 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  39.53 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  39.27 
 
 		 332 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  41.67 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.07 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  41.53 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.51 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  43.62 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.79 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  39.47 
 
 		 331 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  37.79 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  40.73 
 
 		 326 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  37.75 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  41.46 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  40.63 
 
 		 331 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  39.81 
 
 		 337 aa  226  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  36.58 
 
 		 326 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.72 
 
 		 325 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  37.57 
 
 		 325 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.33 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.33 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  41.46 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.72 
 
 		 327 aa  225  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.38 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  42.03 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  38.62 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  39.74 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  39.47 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  38.78 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  38 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  37.87 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  40.74 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  39.52 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  38.71 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  40.65 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  37.43 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>