More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4284 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  68.46 
 
 		 330 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  68.69 
 
 		 335 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  60.18 
 
 		 330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  52.55 
 
 		 325 aa  338  5e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  49.24 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0073  hypothetical protein  46.62 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3968  hypothetical protein  43.93 
 
 		 328 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  45.23 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0610  hypothetical protein  44.63 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417146  normal  0.0239615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  34.36 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  32.9 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  32.9 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  32.9 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  34.24 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  36.07 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  33.33 
 
 		 329 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  30.63 
 
 		 336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  33.23 
 
 		 350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  33.45 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  31.6 
 
 		 327 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  32.09 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  29.91 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  31.94 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  30.56 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  34.73 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  29.75 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  31.88 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  32.33 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  31.58 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  36.5 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  33.77 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  34.88 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  30.7 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  32.89 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.13 
 
 		 328 aa  153  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  33.01 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  32.92 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  32.37 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  31.19 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  33.96 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  34.6 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  31.79 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  34.77 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  33.81 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  32.22 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  32.13 
 
 		 331 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2399  hypothetical protein  31.78 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  33.81 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  31.65 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  31.56 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  35.58 
 
 		 334 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  32.67 
 
 		 334 aa  149  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  32.06 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  33.93 
 
 		 337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  31.27 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  32.78 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  34.59 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  33.23 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  34.6 
 
 		 353 aa  146  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  29.56 
 
 		 351 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  34.63 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  33.97 
 
 		 324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  34.6 
 
 		 328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  32.21 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  36.16 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  30.35 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1846  hypothetical protein  36 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0246944  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  31.77 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  33.77 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  31.17 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1162  hypothetical protein  30 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  34.94 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  29.82 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  33.22 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  33 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  35.36 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  31.21 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  34.4 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  34.4 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  32.7 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  30.72 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  31.94 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  30.98 
 
 		 339 aa  143  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  31.01 
 
 		 358 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  29.7 
 
 		 331 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  32.69 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  31.76 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  33.7 
 
 		 355 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  31.55 
 
 		 325 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  30.1 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  34.96 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  28.34 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  30.37 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  35.83 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  29 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4638  hypothetical protein  29.51 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  33.67 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  32.78 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>