More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2399 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2399  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  643    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  35.76 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.9 
 
 
335 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  35.23 
 
 
335 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  33.88 
 
 
325 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  34.73 
 
 
331 aa  159  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  34.73 
 
 
331 aa  159  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  33.86 
 
 
318 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  33.96 
 
 
328 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  38.02 
 
 
329 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  33.33 
 
 
328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4197  hypothetical protein  30.88 
 
 
316 aa  152  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504073  normal  0.975042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  33.82 
 
 
337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  34.11 
 
 
320 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  34.67 
 
 
332 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  32.65 
 
 
332 aa  152  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  31.97 
 
 
322 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  32.92 
 
 
327 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  34.32 
 
 
331 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  33.46 
 
 
328 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  33.22 
 
 
321 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  37.26 
 
 
329 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  33.46 
 
 
328 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  34.3 
 
 
326 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  31.78 
 
 
335 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  31.56 
 
 
323 aa  149  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  34.28 
 
 
332 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  33.91 
 
 
318 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  34.2 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  31.27 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  34.23 
 
 
327 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  34.52 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  31.72 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  35.05 
 
 
333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  30.31 
 
 
326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  32.98 
 
 
318 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  35.54 
 
 
328 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  35.69 
 
 
335 aa  146  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  34.6 
 
 
330 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  32.99 
 
 
322 aa  145  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  31.54 
 
 
330 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  34.68 
 
 
321 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  33.67 
 
 
326 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  33.77 
 
 
330 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  31.42 
 
 
330 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  29.04 
 
 
324 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  32.7 
 
 
323 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  29.04 
 
 
324 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  31.12 
 
 
327 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  31.12 
 
 
325 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  29.04 
 
 
324 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  31.97 
 
 
329 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  29.97 
 
 
323 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  31.1 
 
 
322 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  33.45 
 
 
332 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  31.54 
 
 
327 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  35.12 
 
 
338 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  35.98 
 
 
326 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  36.4 
 
 
332 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5248  extra-cytoplasmic solute receptor  35.51 
 
 
333 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821441  normal  0.224057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  34.97 
 
 
362 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  34.48 
 
 
325 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  33.12 
 
 
333 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  37.75 
 
 
341 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  34.88 
 
 
322 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  35.64 
 
 
474 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  35.47 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  32 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  36.12 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3300  hypothetical protein  30.26 
 
 
326 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.659933  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  36.11 
 
 
356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  33.46 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  36.13 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  31.21 
 
 
327 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  32.36 
 
 
328 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  33.21 
 
 
339 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  34.04 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  34.38 
 
 
349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  33.86 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  35.66 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  35.38 
 
 
334 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  31.42 
 
 
331 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  30.91 
 
 
327 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  31.5 
 
 
330 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  34.14 
 
 
328 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  30.9 
 
 
332 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  35.76 
 
 
339 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  33.33 
 
 
356 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  34.56 
 
 
337 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  34.75 
 
 
334 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  34.1 
 
 
326 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  33.1 
 
 
318 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  35.14 
 
 
420 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  32.44 
 
 
331 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  30.13 
 
 
318 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  35.6 
 
 
328 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  32.35 
 
 
350 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  35.6 
 
 
328 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  32.53 
 
 
326 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  33.88 
 
 
332 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>