More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5205 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 330 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.63 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.95 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.87 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.3 
 
 		 336 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40.96 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  39.88 
 
 		 344 aa  242  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.67 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.68 
 
 		 328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.68 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  41.86 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.31 
 
 		 345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.31 
 
 		 345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  38.86 
 
 		 327 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.88 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.67 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  40 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  38.7 
 
 		 356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  40.47 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  38.41 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.24 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.19 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  39.13 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.63 
 
 		 328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  38.1 
 
 		 333 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  41.08 
 
 		 348 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.92 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.46 
 
 		 325 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.68 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  37.54 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  37.7 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6149  extra-cytoplasmic solute receptor protein Bug family  39.16 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.873662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  41.2 
 
 		 331 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  39.06 
 
 		 325 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  37.8 
 
 		 332 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  38.02 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.85 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  38.57 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  40.51 
 
 		 326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36.73 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.56 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.73 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  40.4 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  36.9 
 
 		 324 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  36.91 
 
 		 343 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  36.8 
 
 		 351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  36.62 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.77 
 
 		 336 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  36.62 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.5 
 
 		 330 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  39.13 
 
 		 334 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  39.4 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  39.33 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  38.85 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  38.73 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  40 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.44 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  38.08 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  38.19 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.93 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  40.72 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.23 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.18 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  37.73 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.18 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  37.93 
 
 		 322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  39.53 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  40 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  39.66 
 
 		 317 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.58 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  39.08 
 
 		 335 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  39.31 
 
 		 326 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.18 
 
 		 330 aa  215  8e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.18 
 
 		 330 aa  215  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  39.06 
 
 		 322 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  37.46 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  39.56 
 
 		 331 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  33.44 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  36.74 
 
 		 320 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  38.46 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.87 
 
 		 331 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  37.23 
 
 		 358 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  40.55 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  39.37 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  37.63 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  37.07 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.09 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.5 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  39.38 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.37 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.13 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2907  hypothetical protein  39.32 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  39.93 
 
 		 333 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  37.26 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  38.36 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  38.19 
 
 		 322 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  37 
 
 		 337 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  38.94 
 
 		 332 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5677  hypothetical protein  38.16 
 
 		 323 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>