More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0298 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  657    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  35.11 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  36.61 
 
 
324 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  36.61 
 
 
324 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  36.61 
 
 
324 aa  207  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  35.07 
 
 
326 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  35.29 
 
 
322 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  34.95 
 
 
329 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  33.23 
 
 
321 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.91 
 
 
331 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  35.25 
 
 
318 aa  189  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  37.84 
 
 
327 aa  186  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  37.84 
 
 
325 aa  185  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  35.25 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  35.47 
 
 
326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  32.62 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  34.74 
 
 
356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  34.98 
 
 
328 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  34.58 
 
 
329 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  34.55 
 
 
332 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  36.58 
 
 
337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  33.78 
 
 
326 aa  179  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5507  hypothetical protein  35.74 
 
 
319 aa  178  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  32.17 
 
 
330 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  29.65 
 
 
332 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  34.92 
 
 
328 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  30.41 
 
 
328 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.58 
 
 
328 aa  175  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.12 
 
 
327 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  31.72 
 
 
325 aa  175  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  33.86 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  35.37 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  33.11 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  36.24 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  36.45 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  34.11 
 
 
330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  34.56 
 
 
338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  34.11 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  35.35 
 
 
322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  36.52 
 
 
325 aa  173  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  33.33 
 
 
330 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  33.65 
 
 
327 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  32.21 
 
 
332 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0012  hypothetical protein  32.75 
 
 
323 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  34.47 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  34.68 
 
 
304 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  34.46 
 
 
325 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  34.23 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  34.93 
 
 
329 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  30.31 
 
 
320 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3055  hypothetical protein  37.02 
 
 
317 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150263  normal  0.0186232 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  35.49 
 
 
333 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  32.62 
 
 
332 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  33.33 
 
 
326 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  32.09 
 
 
331 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  32.55 
 
 
330 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  32.8 
 
 
321 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  34.55 
 
 
319 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  34.83 
 
 
322 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  33.88 
 
 
335 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.74 
 
 
326 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  33.55 
 
 
320 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  34.8 
 
 
330 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3410  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  36.68 
 
 
317 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.523204  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  33.33 
 
 
332 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  32.89 
 
 
339 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  33.11 
 
 
352 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  31.85 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  31.85 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  31.99 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  30.98 
 
 
337 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  35.35 
 
 
326 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  32.01 
 
 
314 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  34.67 
 
 
331 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  32.43 
 
 
345 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  33.67 
 
 
341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  31.21 
 
 
327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  34.35 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  31.9 
 
 
333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  30.89 
 
 
318 aa  165  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  33.11 
 
 
327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  36.36 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  35.07 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  33.23 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  32.29 
 
 
420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  32.14 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  35.04 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  33.45 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  32.21 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  33.9 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3581  hypothetical protein  33.56 
 
 
331 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0733859  normal  0.0164081 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  31.55 
 
 
339 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  34.4 
 
 
326 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  31.76 
 
 
324 aa  162  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  32.21 
 
 
325 aa  162  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  31.8 
 
 
328 aa  162  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  32.7 
 
 
327 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  33.33 
 
 
322 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  31.54 
 
 
326 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  31.62 
 
 
331 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>