More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5887 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  40.56 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  40.25 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.84 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  41.12 
 
 		 332 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  41.2 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.31 
 
 		 323 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  44.12 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.14 
 
 		 325 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  39.18 
 
 		 321 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  40 
 
 		 317 aa  222  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.42 
 
 		 325 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  42.09 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  39.66 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  42.67 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.14 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.58 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  39.13 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  38.61 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.72 
 
 		 339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  41.81 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  39.74 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.73 
 
 		 331 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  37.9 
 
 		 332 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.04 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  40.53 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  38.85 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  39.46 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.2 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  42.96 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.17 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.06 
 
 		 314 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  39.88 
 
 		 325 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.33 
 
 		 324 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  38.74 
 
 		 327 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  37.42 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  39.46 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  38.23 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  41 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.13 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.56 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1975  hypothetical protein  42.76 
 
 		 328 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222715  normal  0.0272576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  38.17 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.26 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  40.07 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  39.46 
 
 		 329 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  38.28 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.87 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.39 
 
 		 328 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  40.07 
 
 		 332 aa  212  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 		 328 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  38.26 
 
 		 325 aa  212  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  39.53 
 
 		 329 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  42.37 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  37.46 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.46 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  40.19 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.02 
 
 		 335 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  38.49 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  38.76 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.59 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  39.5 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  40.89 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.59 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.28 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.27 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  37.42 
 
 		 321 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  37.97 
 
 		 327 aa  209  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  43.4 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.28 
 
 		 328 aa  209  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3819  hypothetical protein  39.81 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  40.98 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.46 
 
 		 330 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.46 
 
 		 330 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  41.95 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  41.95 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.73 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  37.5 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  36.19 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  36.96 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4413  hypothetical protein  38 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112259  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.61 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  37.94 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  41.14 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  37.95 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  38.64 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  38.94 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1292  hypothetical protein  41.64 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.22 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  40.07 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  38.06 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  37.19 
 
 		 325 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3791  hypothetical protein  40.37 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  39.53 
 
 		 332 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  36.54 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  39.32 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  38.7 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  39.2 
 
 		 326 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>