More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4413 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4413  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112259  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2041  hypothetical protein  72.54 
 
 		 320 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2875  hypothetical protein  58.53 
 
 		 335 aa  353  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3076  hypothetical protein  56.27 
 
 		 323 aa  345  7e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3581  hypothetical protein  53.36 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0733859  normal  0.0164081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  41.53 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  41.75 
 
 		 338 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  42.96 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.13 
 
 		 323 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  39.33 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  38.72 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  39.46 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  39.59 
 
 		 362 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1728  hypothetical protein  40 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000138384  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.84 
 
 		 349 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  38.13 
 
 		 345 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  38.08 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.02 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  38.82 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  39.26 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.74 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.74 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.87 
 
 		 314 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  39.6 
 
 		 322 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.53 
 
 		 318 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  39.53 
 
 		 325 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.82 
 
 		 327 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  42.18 
 
 		 323 aa  215  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  37.7 
 
 		 331 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  38.59 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  38.59 
 
 		 316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.13 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.61 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.13 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  37.42 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5147  extra-cytoplasmic solute receptor  39.6 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.698563  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.02 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.93 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1674  hypothetical protein  39.32 
 
 		 326 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.05 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1794  hypothetical protein  38.49 
 
 		 322 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0184484  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.26 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1994  hypothetical protein  38.49 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00362251  normal  0.711901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3101  hypothetical protein  38.21 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.26 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  38.46 
 
 		 328 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.93 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  37.71 
 
 		 338 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  38 
 
 		 323 aa  205  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.84 
 
 		 325 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.88 
 
 		 327 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  40.6 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  38.31 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  38.05 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  40.14 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  37.97 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  38 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  37.12 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.49 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  35.43 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  38.93 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.26 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  37.37 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  37.62 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  38.98 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  36.58 
 
 		 328 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  36 
 
 		 330 aa  202  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  36.36 
 
 		 327 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.49 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  37.79 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  38.41 
 
 		 329 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0210  hypothetical protein  36.52 
 
 		 322 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.61 
 
 		 335 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  39.93 
 
 		 325 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  41.86 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  37.21 
 
 		 320 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  39.74 
 
 		 321 aa  202  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  36.15 
 
 		 329 aa  202  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.21 
 
 		 325 aa  201  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  36.7 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  37.92 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4109  extra-cytoplasmic solute receptor  38.21 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  38.36 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  39.33 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  36.3 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  38.59 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.37 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  35.35 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.57 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  36.88 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  37.21 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  36.63 
 
 		 349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  36.96 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  38.94 
 
 		 337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  36.49 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  37.12 
 
 		 330 aa  198  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3532  hypothetical protein  36.03 
 
 		 341 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  37.58 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>