More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4109 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4109  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 334 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  41.99 
 
 		 326 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  42.66 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.63 
 
 		 344 aa  232  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.94 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  38.33 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  40.69 
 
 		 332 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.85 
 
 		 310 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.81 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  39.81 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.82 
 
 		 351 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.19 
 
 		 358 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  39.63 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.31 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.8 
 
 		 339 aa  225  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.29 
 
 		 325 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  42.72 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.14 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.21 
 
 		 332 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.77 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  38.27 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.77 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.82 
 
 		 324 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.02 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.91 
 
 		 334 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  39.25 
 
 		 334 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.59 
 
 		 330 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.54 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  39 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  36.71 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  37.33 
 
 		 338 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  39.62 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  39.88 
 
 		 322 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  38.28 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  37.65 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1522  hypothetical protein  35.8 
 
 		 326 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.27 
 
 		 336 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  38.14 
 
 		 335 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.89 
 
 		 328 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5878  hypothetical protein  40.74 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.62 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.84 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  35.37 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  38.83 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  35.78 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.8 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.31 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  39.26 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.81 
 
 		 328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  39.31 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  37.54 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  38.41 
 
 		 320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  37.99 
 
 		 322 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  211  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.33 
 
 		 327 aa  212  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  37.76 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  39.31 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.81 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  37.95 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  37.29 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  37.8 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  38.44 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  37.8 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  36.09 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  38.2 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  37.54 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  36.62 
 
 		 335 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  37.8 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  36.68 
 
 		 323 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  35.53 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  37.97 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.29 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  37.98 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.88 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2875  hypothetical protein  39.32 
 
 		 335 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.54 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.27 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.18 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  38.06 
 
 		 328 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  34.29 
 
 		 325 aa  208  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  36.06 
 
 		 356 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  38.18 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  36.68 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  35.94 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  36.45 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  36.05 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  38.58 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  38.76 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  39.93 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.1 
 
 		 324 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.53 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  37.5 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  36.3 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.7 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  38.39 
 
 		 323 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  37.54 
 
 		 329 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  35.44 
 
 		 322 aa  205  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  38.23 
 
 		 353 aa  205  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  36.76 
 
 		 329 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>