More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2041 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2041  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  645    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4413  hypothetical protein  72.54 
 
 		 302 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3076  hypothetical protein  55.35 
 
 		 323 aa  351  7e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2875  hypothetical protein  57.67 
 
 		 335 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105708  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3581  hypothetical protein  51.96 
 
 		 331 aa  332  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0733859  normal  0.0164081 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.68 
 
 		 328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.91 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  35.8 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  35.35 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  38.8 
 
 		 338 aa  211  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  35 
 
 		 325 aa  211  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1728  hypothetical protein  35.88 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000138384  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1794  hypothetical protein  37.54 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0184484  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  36.88 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1994  hypothetical protein  36.88 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00362251  normal  0.711901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  38.91 
 
 		 349 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  36.36 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  37.38 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  36.36 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.36 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.21 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.21 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  36.25 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  38.93 
 
 		 331 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.26 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  36 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.45 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  40.2 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  36.59 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.21 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  35.22 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  36.03 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  34.38 
 
 		 328 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  35.46 
 
 		 333 aa  202  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  38.64 
 
 		 331 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  35.91 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  36.02 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  35.24 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.26 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  35.62 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  34.67 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  35.83 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  33.76 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  37.14 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4109  extra-cytoplasmic solute receptor  38.44 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  36.22 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  33.74 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  35.74 
 
 		 337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  36.09 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  35.71 
 
 		 325 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  38.54 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  35.86 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3101  hypothetical protein  35.59 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  35.23 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  37.31 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  37.67 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  33.74 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  34.8 
 
 		 329 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  34.17 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  38.57 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1674  hypothetical protein  36.11 
 
 		 326 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.86 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  35.05 
 
 		 329 aa  195  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  33.64 
 
 		 322 aa  195  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  36.21 
 
 		 328 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  35.35 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  36.51 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  36.98 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.44 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.64 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  36.96 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  35.11 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  33.67 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  35.55 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4638  hypothetical protein  33.78 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  35.16 
 
 		 314 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  35.38 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  35.86 
 
 		 330 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  34.11 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  34.67 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  32.57 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  35.2 
 
 		 339 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  38.31 
 
 		 335 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  35.4 
 
 		 326 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  34.8 
 
 		 318 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  35.97 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  34.9 
 
 		 349 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  35.79 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  35.45 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  34.48 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  34.88 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  34.47 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  34.88 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  34.34 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  35.23 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.38 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  33.56 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  36.36 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1006  twin-arginine translocation pathway signal  33.44 
 
 		 333 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>