More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3076 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3076  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2875  hypothetical protein  80.6 
 
 		 335 aa  534  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105708  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2041  hypothetical protein  55.66 
 
 		 320 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4413  hypothetical protein  56.04 
 
 		 302 aa  345  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112259  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3581  hypothetical protein  56.91 
 
 		 331 aa  335  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0733859  normal  0.0164081 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.04 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  41.44 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.75 
 
 		 325 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  41.18 
 
 		 326 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.63 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.29 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.51 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.18 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.8 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.85 
 
 		 328 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.23 
 
 		 327 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.06 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  40.69 
 
 		 322 aa  222  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  39.26 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.16 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1994  hypothetical protein  38.74 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00362251  normal  0.711901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1794  hypothetical protein  38.74 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0184484  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.73 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.33 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.73 
 
 		 327 aa  219  6e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.33 
 
 		 328 aa  218  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.33 
 
 		 328 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  38.05 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.53 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  37.54 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  36.25 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.27 
 
 		 328 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  37.38 
 
 		 332 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  37.61 
 
 		 339 aa  215  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  40.12 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.31 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.58 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  36.36 
 
 		 356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1728  hypothetical protein  38.41 
 
 		 324 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000138384  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.62 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  40.2 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  38.94 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  37.14 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.29 
 
 		 330 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  34.89 
 
 		 331 aa  209  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  34.89 
 
 		 331 aa  209  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.31 
 
 		 332 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  35.78 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  38.93 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  37.96 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  36.54 
 
 		 325 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  37.8 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4109  extra-cytoplasmic solute receptor  39.8 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  38.76 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  37.21 
 
 		 326 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37 
 
 		 336 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.26 
 
 		 327 aa  206  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  37.74 
 
 		 324 aa  205  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  37.42 
 
 		 324 aa  205  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  37.5 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  40.13 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  37.26 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  35.98 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  36.98 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  36.77 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  39.67 
 
 		 323 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  38.07 
 
 		 319 aa  202  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.67 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  37.54 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.92 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  37.5 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.92 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  36.36 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  37.5 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  37.19 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  36.28 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3101  hypothetical protein  37.29 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  35.28 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1006  twin-arginine translocation pathway signal  37.29 
 
 		 333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  39.04 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.33 
 
 		 325 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.21 
 
 		 314 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  36.31 
 
 		 332 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0972  hypothetical protein  38.14 
 
 		 320 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0157499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1162  hypothetical protein  35.09 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  35.22 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  37.54 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  35.28 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  34.78 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  35.55 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  36.36 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.97 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  35.23 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  35.31 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  36.7 
 
 		 335 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  35.45 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  38.24 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  39.13 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  37.77 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  38.3 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>