More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3819 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3819  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4341  extra-cytoplasmic solute receptor  88.29 
 
 
320 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  53.44 
 
 
323 aa  335  5e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  47.83 
 
 
321 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  45.72 
 
 
327 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.01 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  47.5 
 
 
327 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  46.36 
 
 
322 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  47.77 
 
 
331 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.61 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.64 
 
 
339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  47.81 
 
 
328 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.67 
 
 
330 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.51 
 
 
328 aa  261  8e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  45.82 
 
 
326 aa  261  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  45.79 
 
 
322 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  45.28 
 
 
339 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  43.67 
 
 
329 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  45.82 
 
 
335 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.52 
 
 
324 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  43.81 
 
 
327 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  44.09 
 
 
351 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.04 
 
 
345 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.04 
 
 
345 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.18 
 
 
331 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  44.85 
 
 
336 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  44.82 
 
 
335 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  43.14 
 
 
332 aa  255  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  43.42 
 
 
304 aa  255  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.12 
 
 
325 aa  255  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.75 
 
 
333 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  45.93 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.81 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.81 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  43.2 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  46.31 
 
 
355 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.85 
 
 
335 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  44.12 
 
 
344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  45.25 
 
 
334 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.36 
 
 
336 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  42.76 
 
 
320 aa  251  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  44.63 
 
 
334 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.3 
 
 
330 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  43.87 
 
 
323 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44.3 
 
 
330 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  44 
 
 
328 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  41.3 
 
 
322 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.38 
 
 
326 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  42.76 
 
 
332 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  41.23 
 
 
330 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.69 
 
 
360 aa  249  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.18 
 
 
358 aa  248  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  44.22 
 
 
333 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  42.9 
 
 
327 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  42.67 
 
 
333 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  44.65 
 
 
356 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  43.83 
 
 
325 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.38 
 
 
322 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  44.63 
 
 
335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  43.28 
 
 
344 aa  245  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  43.04 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  42.09 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  42.19 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.3 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.68 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  42.76 
 
 
325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  45.3 
 
 
353 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  43.85 
 
 
322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  42.67 
 
 
335 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  43.17 
 
 
325 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42 
 
 
314 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.25 
 
 
318 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  45.45 
 
 
335 aa  242  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.47 
 
 
330 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.2 
 
 
325 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  45.03 
 
 
324 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.2 
 
 
349 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.56 
 
 
325 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  42.3 
 
 
332 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  42.52 
 
 
324 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  43.09 
 
 
348 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  42.03 
 
 
325 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.9 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  42.52 
 
 
341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  42.19 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  42.11 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  41.46 
 
 
320 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  43 
 
 
356 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  43.91 
 
 
328 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  42.09 
 
 
326 aa  238  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.24 
 
 
334 aa  238  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.71 
 
 
328 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  41.86 
 
 
334 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  43.88 
 
 
325 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  43 
 
 
334 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  40.86 
 
 
334 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  43.48 
 
 
330 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.27 
 
 
339 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  41.47 
 
 
343 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.75 
 
 
332 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>