More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0982 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  645    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  55.59 
 
 		 326 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  54.61 
 
 		 318 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  51.4 
 
 		 350 aa  317  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  47.78 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  48.68 
 
 		 324 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  48.68 
 
 		 324 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  48.68 
 
 		 324 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  50.39 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  41.02 
 
 		 331 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  36.45 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  34.36 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  34.06 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  34.06 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  37.39 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  36.09 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  29.85 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  34.44 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  36.24 
 
 		 335 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  32.93 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  32.99 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  33.11 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  35.95 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  35.06 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  33.8 
 
 		 325 aa  169  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  32.21 
 
 		 338 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  33.78 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  33.99 
 
 		 339 aa  165  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  36.93 
 
 		 325 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  33 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  34.98 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  35.8 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  32.5 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  32.32 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  33.89 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  34.43 
 
 		 331 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0620  hypothetical protein  36.12 
 
 		 322 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  34.86 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  37.1 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  34.65 
 
 		 331 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  33.64 
 
 		 326 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  33.78 
 
 		 322 aa  162  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0906  hypothetical protein  33.53 
 
 		 328 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  33.94 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  38.35 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  34.33 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  31.72 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  31.65 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  33.88 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  35.61 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  33.73 
 
 		 377 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  36.82 
 
 		 331 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3410  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  34.35 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.523204  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3055  hypothetical protein  34.01 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150263  normal  0.0186232 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  34.28 
 
 		 331 aa  159  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5298  hypothetical protein  38.03 
 
 		 314 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  34.51 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  34.11 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  33.89 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  34.62 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  32.52 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  32.99 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  34.78 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  34.38 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  33.78 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  33.54 
 
 		 331 aa  156  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  33.84 
 
 		 332 aa  156  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  34.35 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  33.75 
 
 		 334 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  33.44 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  33.82 
 
 		 330 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0061  hypothetical protein  34.39 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  34.31 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  36.3 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  33.88 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  32.43 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  35.64 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  32.58 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  32.14 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  35.29 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  35.13 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  28.86 
 
 		 336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4309  hypothetical protein  31.02 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  32.58 
 
 		 316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  32.14 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  35.38 
 
 		 335 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  34.22 
 
 		 342 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  31.15 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  34.35 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  31.67 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  32.91 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  33.89 
 
 		 335 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  34.6 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  35.31 
 
 		 333 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  34.96 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  32.87 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  33.54 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  31.1 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>