More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1436 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  43.48 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  42.33 
 
 		 326 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  41.64 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  41.58 
 
 		 335 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  40.94 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  40.13 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  38.83 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  37.85 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  37.85 
 
 		 323 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  37.67 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  38.31 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  36.84 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  37.97 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  37.09 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  32.95 
 
 		 383 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  36.05 
 
 		 336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  34.69 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  35.79 
 
 		 331 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  35.85 
 
 		 331 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  36.66 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  35.02 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  36.83 
 
 		 320 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  36.59 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  36.09 
 
 		 337 aa  192  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  34.98 
 
 		 339 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  40.62 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  37.33 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  37.45 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4109  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  33.98 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  39.46 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  38.52 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  38.46 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  34.93 
 
 		 334 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  35.27 
 
 		 351 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  35.85 
 
 		 358 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  33.12 
 
 		 326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  35.56 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  34.27 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  32.43 
 
 		 377 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  34.77 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  36.52 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  34.36 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  37.28 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  35.92 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.56 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  34.95 
 
 		 327 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  35.37 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.15 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  36.96 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  36.07 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.15 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  35.03 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  32.11 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5765  hypothetical protein  33.45 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  34.78 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  34.98 
 
 		 329 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  37.54 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  34.44 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5175  hypothetical protein  32.35 
 
 		 332 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  36.84 
 
 		 331 aa  178  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  34.65 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  32.92 
 
 		 333 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  33.44 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  35.5 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4415  extra-cytoplasmic solute receptor  34.58 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.597884  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  36.05 
 
 		 335 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  35.94 
 
 		 338 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  33.96 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  34.78 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0187  hypothetical protein  36.33 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  36.27 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  37.64 
 
 		 331 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  33.77 
 
 		 325 aa  175  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  33.44 
 
 		 326 aa  175  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  36.49 
 
 		 332 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  34.08 
 
 		 328 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4341  extra-cytoplasmic solute receptor  36.28 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  34.06 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4101  extra-cytoplasmic solute receptor  35.2 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0889008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  32.11 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  32.99 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  39.23 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  34.55 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  39.19 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  37.78 
 
 		 326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  30.98 
 
 		 356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0058  hypothetical protein  34.56 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  36.12 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  33.66 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  36.39 
 
 		 323 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  35.83 
 
 		 356 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  35.03 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  31.37 
 
 		 329 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  33.01 
 
 		 327 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  32.65 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  32.59 
 
 		 327 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  33.95 
 
 		 325 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  33 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>