More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3035 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  678    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  66.89 
 
 		 331 aa  428  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  50.3 
 
 		 377 aa  328  6e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  47.12 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  45.67 
 
 		 327 aa  291  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  44.41 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  45.67 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  42.99 
 
 		 323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  42.99 
 
 		 323 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  45.33 
 
 		 326 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  45.36 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  45.89 
 
 		 335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  44.22 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  39.13 
 
 		 336 aa  238  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  41.12 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  41.64 
 
 		 331 aa  235  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  43.34 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  39.25 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  37.32 
 
 		 383 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  37.1 
 
 		 318 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  38.72 
 
 		 339 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  38.91 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  34.78 
 
 		 327 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5765  hypothetical protein  39.53 
 
 		 326 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  37.69 
 
 		 331 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.47 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  37.17 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  33.9 
 
 		 321 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  35.4 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  34.05 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  35.4 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  33.76 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  33.44 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  33.75 
 
 		 328 aa  162  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  35.03 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  35.22 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  32.72 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  32.5 
 
 		 356 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4109  extra-cytoplasmic solute receptor  35.89 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  35.55 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  33.11 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  31.99 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5248  extra-cytoplasmic solute receptor  37.87 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821441  normal  0.224057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  33.44 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0058  hypothetical protein  32.17 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  33.96 
 
 		 338 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  36.33 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5116  hypothetical protein  33.97 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  34.06 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  31.92 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  35.61 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  34.01 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  32.21 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  31.44 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  33.88 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  33.56 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  33.76 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  33.97 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  34.01 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  35.4 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  32.66 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0277  hypothetical protein  32.14 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  37.31 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  35.19 
 
 		 322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  32.25 
 
 		 327 aa  152  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  152  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.12 
 
 		 331 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0026  hypothetical protein  31.54 
 
 		 363 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3609  hypothetical protein  34.92 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal  0.0172311 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  32.67 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  32.78 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  31.1 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4419  hypothetical protein  38.03 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  34.7 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  34.77 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  33.45 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  35.42 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  34.39 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  32.13 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  34.8 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  37.63 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  36.64 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  30.18 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  34.17 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  30.77 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  31.46 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  31.79 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  31.17 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  33.65 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  33.9 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0989  hypothetical protein  33.56 
 
 		 325 aa  149  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  36.5 
 
 		 327 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  34.53 
 
 		 322 aa  149  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  35.74 
 
 		 322 aa  149  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  35.74 
 
 		 325 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  32.49 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  32.15 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  32.13 
 
 		 350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1257  hypothetical protein  33.22 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>