More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2348 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  674    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  85.37 
 
 		 332 aa  571  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  78.09 
 
 		 336 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  73.48 
 
 		 324 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  74 
 
 		 331 aa  471  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  74.41 
 
 		 339 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  45.37 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  45.05 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  42.52 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  41.88 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  41.84 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  41.56 
 
 		 323 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  46.23 
 
 		 326 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  45.02 
 
 		 324 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  40.8 
 
 		 377 aa  245  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  38.44 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  41.64 
 
 		 338 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  37.73 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  42.61 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  40.61 
 
 		 325 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  37.16 
 
 		 333 aa  225  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5765  hypothetical protein  37.29 
 
 		 326 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  35.85 
 
 		 318 aa  205  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  33.53 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  38.6 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  38.52 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  41.49 
 
 		 320 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  39.79 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  42.25 
 
 		 329 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  37.39 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  38.11 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  36.4 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  38.85 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  38.49 
 
 		 333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  40.61 
 
 		 321 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  36.67 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  37.23 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  41.25 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  37.85 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  34.98 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  35.69 
 
 		 330 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  33.94 
 
 		 331 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  35.71 
 
 		 350 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  37.94 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  39.85 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  37.84 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  36.58 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.6 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  40.3 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  35.11 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  39.15 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  35.76 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  38.15 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  37.45 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  34.29 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  39.47 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  37.55 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  39.23 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  39.11 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  35.97 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  36.88 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  37.64 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  37.64 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  33.81 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0728  twin-arginine translocation pathway signal  36.16 
 
 		 320 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  35.85 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  37.13 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  34.36 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.61 
 
 		 327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.46 
 
 		 321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  33.79 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  36.19 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  33.79 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  37.86 
 
 		 325 aa  162  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  39.51 
 
 		 321 aa  162  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  37.84 
 
 		 325 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  36.56 
 
 		 356 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.62 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.85 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0125  hypothetical protein  34.6 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  39.25 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.08 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  38.75 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.72 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.72 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  35.62 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  37.13 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  37.45 
 
 		 353 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.8 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  39.08 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0143  hypothetical protein  34.22 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  35.92 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5298  hypothetical protein  35.2 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3854  hypothetical protein  36.01 
 
 		 328 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  36.09 
 
 		 334 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  32.93 
 
 		 352 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  36.03 
 
 		 351 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  37.45 
 
 		 328 aa  159  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  34.5 
 
 		 338 aa  159  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  37.65 
 
 		 325 aa  159  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>