More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1712 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  35.76 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  35.81 
 
 		 326 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  34.08 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  34.08 
 
 		 324 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  34.08 
 
 		 324 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  34.94 
 
 		 333 aa  169  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  35.84 
 
 		 330 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  33.8 
 
 		 326 aa  169  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  35.11 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  36.43 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  30.43 
 
 		 333 aa  165  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  36.24 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  32.88 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  34.07 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  39.63 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  32.68 
 
 		 329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  37.84 
 
 		 331 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  35.38 
 
 		 331 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  37.29 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  32.17 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  36.25 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3088  hypothetical protein  36.53 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  32.92 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  36.14 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  32.09 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  33.45 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  31.96 
 
 		 327 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  32.82 
 
 		 351 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  32.54 
 
 		 320 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  31.51 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0210  hypothetical protein  33.22 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  32.53 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  36.23 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  34.28 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  34.19 
 
 		 320 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  35.29 
 
 		 322 aa  152  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  31.31 
 
 		 322 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  31.85 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  32.53 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  32.54 
 
 		 320 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  31.49 
 
 		 318 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  31.86 
 
 		 340 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  32.08 
 
 		 333 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  33.72 
 
 		 339 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  35.69 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  33.56 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  28.48 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  31.06 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  31.15 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  30.43 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  34.81 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  30.57 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  34.34 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  31.58 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  30.84 
 
 		 333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  30.09 
 
 		 331 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  30.74 
 
 		 318 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  30 
 
 		 350 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4804  hypothetical protein  32.87 
 
 		 350 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.589881  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  32.64 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3164  hypothetical protein  32.67 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0596  hypothetical protein  32.23 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.096367  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  35.38 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  30.61 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  31.86 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  31.62 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  33.79 
 
 		 328 aa  143  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  30.7 
 
 		 326 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  30.13 
 
 		 328 aa  142  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  33.45 
 
 		 353 aa  142  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  32.11 
 
 		 337 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  29.07 
 
 		 329 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  30.59 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  30.85 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3508  hypothetical protein  31.83 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  31.45 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  30.53 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  31.31 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  32.99 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2769  hypothetical protein  34.01 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  31.91 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4274  hypothetical protein  32.63 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0445604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  32.73 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  30.85 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  31.21 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  36.14 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  29.63 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  31.51 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  28.33 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  31.51 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2286  hypothetical protein  30.15 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.53441  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  28.29 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  31.06 
 
 		 330 aa  139  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  30.14 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  29.02 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  28.91 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>