More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3164 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3164  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  665    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  37.58 
 
 
331 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  37.42 
 
 
325 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.59 
 
 
331 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.44 
 
 
328 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  36.81 
 
 
332 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.46 
 
 
330 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  38.85 
 
 
322 aa  206  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.46 
 
 
330 aa  205  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.79 
 
 
335 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  37.58 
 
 
339 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  34.56 
 
 
331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  34.56 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  37.01 
 
 
328 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  38.39 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  37.5 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  37.5 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.21 
 
 
330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  34.2 
 
 
331 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.2 
 
 
327 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  36.3 
 
 
330 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  38.67 
 
 
323 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  35.29 
 
 
336 aa  195  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  34.55 
 
 
328 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  34.55 
 
 
328 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  37.79 
 
 
333 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.25 
 
 
335 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  34.17 
 
 
333 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  34.89 
 
 
325 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36 
 
 
327 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  36 
 
 
325 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  35.85 
 
 
323 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  35.87 
 
 
321 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0039  hypothetical protein  32.81 
 
 
324 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  34.05 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  32.67 
 
 
327 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  35.37 
 
 
336 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  35.47 
 
 
335 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  33.74 
 
 
316 aa  189  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  34.48 
 
 
332 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  34.05 
 
 
333 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  34.2 
 
 
343 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  35.19 
 
 
326 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  34.78 
 
 
322 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0210  hypothetical protein  36.36 
 
 
322 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  37.5 
 
 
317 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  38.67 
 
 
328 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  37.3 
 
 
334 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  35.9 
 
 
320 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  35.39 
 
 
328 aa  185  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  33.12 
 
 
329 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  37.16 
 
 
317 aa  185  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  34.85 
 
 
344 aa  185  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  36.18 
 
 
360 aa  185  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  38.46 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  33.22 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  32.93 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  35.42 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  35.62 
 
 
304 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  38.8 
 
 
386 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  34.9 
 
 
349 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  37.05 
 
 
327 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  32.91 
 
 
325 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  35.95 
 
 
327 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  34.11 
 
 
331 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  37.03 
 
 
320 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  32.63 
 
 
328 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  35.57 
 
 
321 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  33.85 
 
 
324 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  34.44 
 
 
327 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  32.56 
 
 
332 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  33.11 
 
 
324 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  33.78 
 
 
362 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2931  hypothetical protein  35.91 
 
 
317 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  33.97 
 
 
334 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  34.54 
 
 
336 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  36.18 
 
 
333 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  33.75 
 
 
338 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4844  hypothetical protein  34.46 
 
 
322 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  35.81 
 
 
322 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  31.79 
 
 
337 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  36.12 
 
 
322 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  34.11 
 
 
338 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  34.21 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  35.23 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  34.21 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
331 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  34.53 
 
 
339 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  33.44 
 
 
335 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  34.31 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  34.52 
 
 
330 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5869  extra-cytoplasmic solute receptor  33.45 
 
 
346 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  33.76 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  34.64 
 
 
335 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  37.05 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  36.42 
 
 
324 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  34.8 
 
 
321 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  33.77 
 
 
328 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  35.88 
 
 
332 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  33.66 
 
 
344 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>