More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2931 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2931  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  643    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.82 
 
 
336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  46.84 
 
 
324 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.05 
 
 
328 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.55 
 
 
330 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.77 
 
 
327 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  43.35 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.67 
 
 
328 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.48 
 
 
327 aa  248  9e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.14 
 
 
330 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.14 
 
 
330 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.9 
 
 
335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.73 
 
 
360 aa  245  8e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.33 
 
 
339 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.23 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  44.41 
 
 
328 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.41 
 
 
328 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  41.14 
 
 
337 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  43.57 
 
 
326 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.83 
 
 
330 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  42.62 
 
 
331 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  42 
 
 
335 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  42.07 
 
 
331 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  42.07 
 
 
331 aa  238  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.14 
 
 
330 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.84 
 
 
349 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.9 
 
 
339 aa  236  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.9 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  42.17 
 
 
318 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.58 
 
 
323 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.12 
 
 
345 aa  235  7e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.12 
 
 
345 aa  235  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.38 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.52 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.42 
 
 
328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  42.77 
 
 
333 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  39.87 
 
 
321 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  40.33 
 
 
342 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.94 
 
 
328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.63 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  41.2 
 
 
325 aa  232  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  41.64 
 
 
332 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.71 
 
 
328 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.16 
 
 
344 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  41.35 
 
 
325 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  42.14 
 
 
330 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  40.52 
 
 
331 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  40.46 
 
 
330 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  40.67 
 
 
335 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.19 
 
 
327 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.08 
 
 
325 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  40.45 
 
 
339 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  39.06 
 
 
331 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  38.98 
 
 
321 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  42.48 
 
 
386 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.56 
 
 
358 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  40.67 
 
 
352 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.48 
 
 
332 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  39.39 
 
 
332 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  40 
 
 
333 aa  226  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  39.33 
 
 
330 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.65 
 
 
314 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  39.2 
 
 
326 aa  225  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.32 
 
 
328 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  40.2 
 
 
335 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.48 
 
 
310 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  39.27 
 
 
327 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  42.23 
 
 
335 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  37.46 
 
 
326 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  40.35 
 
 
322 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  38.1 
 
 
326 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 
327 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  40.2 
 
 
335 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.87 
 
 
322 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.16 
 
 
325 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.03 
 
 
325 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  37.82 
 
 
334 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  39.4 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  40.82 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.89 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.89 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  36.96 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.61 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  38.23 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  41.39 
 
 
328 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  39.87 
 
 
323 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.05 
 
 
304 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  42.81 
 
 
474 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  41.28 
 
 
326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40.06 
 
 
323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  37.46 
 
 
330 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  41.28 
 
 
349 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  40.88 
 
 
339 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.13 
 
 
325 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40.61 
 
 
327 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  39.37 
 
 
326 aa  218  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  39.53 
 
 
324 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  38.46 
 
 
323 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  37.81 
 
 
324 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.33 
 
 
335 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>