More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4804 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4804  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  702    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.589881  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  88.36 
 
 
316 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  88.7 
 
 
316 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0210  hypothetical protein  88.7 
 
 
322 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  49.54 
 
 
330 aa  315  6e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  55.82 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  46.1 
 
 
330 aa  282  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  43.67 
 
 
329 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  46.69 
 
 
345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  46.69 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.92 
 
 
336 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  43.2 
 
 
332 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  44.9 
 
 
320 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  43.2 
 
 
332 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.4 
 
 
339 aa  262  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.68 
 
 
328 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.65 
 
 
328 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.71 
 
 
330 aa  256  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.71 
 
 
330 aa  255  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  46.44 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.15 
 
 
327 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.86 
 
 
344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  45.03 
 
 
360 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.57 
 
 
328 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.08 
 
 
327 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.57 
 
 
328 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  46.22 
 
 
334 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.03 
 
 
331 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  45.7 
 
 
335 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.05 
 
 
339 aa  245  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.18 
 
 
333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.57 
 
 
323 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.33 
 
 
333 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.52 
 
 
330 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  44.41 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.62 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  45.28 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  44.19 
 
 
322 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  42.07 
 
 
318 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  39.51 
 
 
330 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  44.41 
 
 
323 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  45.33 
 
 
333 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  41.84 
 
 
322 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.55 
 
 
324 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  42.23 
 
 
331 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.03 
 
 
331 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.58 
 
 
314 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.26 
 
 
333 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.14 
 
 
325 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.09 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  42.57 
 
 
320 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.73 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  46.44 
 
 
386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.73 
 
 
327 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.28 
 
 
344 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  43.3 
 
 
327 aa  231  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40.98 
 
 
318 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  41.69 
 
 
332 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.55 
 
 
339 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  41.21 
 
 
331 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  42.12 
 
 
335 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  42.62 
 
 
332 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  40.2 
 
 
321 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  42.9 
 
 
335 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  38.66 
 
 
332 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  41.2 
 
 
331 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  40.39 
 
 
326 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.65 
 
 
328 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  40.69 
 
 
324 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.75 
 
 
327 aa  227  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  42.14 
 
 
335 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.02 
 
 
349 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  41.08 
 
 
334 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  40.13 
 
 
321 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  43.24 
 
 
322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  39.93 
 
 
323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5716  hypothetical protein  42.35 
 
 
334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  41.98 
 
 
335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  41.14 
 
 
323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  38.75 
 
 
325 aa  226  6e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  41.14 
 
 
323 aa  225  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  41.28 
 
 
328 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.02 
 
 
328 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  42.57 
 
 
330 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  40.39 
 
 
322 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  41.89 
 
 
327 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  43.29 
 
 
326 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  44.48 
 
 
324 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  42.18 
 
 
324 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  41.64 
 
 
331 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.58 
 
 
336 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40 
 
 
337 aa  223  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4274  hypothetical protein  40.68 
 
 
318 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0445604  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  40.19 
 
 
337 aa  223  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  40.48 
 
 
322 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  38.79 
 
 
339 aa  222  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  41.02 
 
 
321 aa  222  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  39.7 
 
 
336 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.8 
 
 
339 aa  222  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  38.98 
 
 
323 aa  222  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>