More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2286 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2286  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  671    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.53441  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  39.36 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  38.13 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  37.09 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  36.36 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  35.74 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  33.87 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  35.41 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  33.22 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  35 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  34.48 
 
 		 316 aa  158  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5716  hypothetical protein  35.34 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  34.71 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  33.65 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5298  hypothetical protein  37.75 
 
 		 314 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  34.84 
 
 		 332 aa  155  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  34.12 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  33.69 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  38.43 
 
 		 325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  34.98 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  33.13 
 
 		 327 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  33.76 
 
 		 329 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4804  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.589881  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  33.11 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  35.97 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  29.43 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  33.11 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  32.7 
 
 		 356 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0709  hypothetical protein  32.65 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  32.04 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  31.8 
 
 		 339 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0039  hypothetical protein  34.04 
 
 		 324 aa  149  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  32.91 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  32.66 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  33.13 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  32.85 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  33.94 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  31.68 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  34.33 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  31.53 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  35.12 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  32.69 
 
 		 335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  32.99 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  31.93 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  30.51 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  31.78 
 
 		 335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  29.47 
 
 		 324 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2041  hypothetical protein  31.42 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  32.54 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  30.99 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3581  hypothetical protein  31.48 
 
 		 331 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0733859  normal  0.0164081 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4109  extra-cytoplasmic solute receptor  31.87 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  29.14 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3390  hypothetical protein  33.78 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254723  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4413  hypothetical protein  32.44 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  29.14 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0210  hypothetical protein  33.22 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  33.87 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  31.12 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  31.23 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  34.38 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  31.74 
 
 		 325 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  32.77 
 
 		 319 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  34.12 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  34.67 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  30.53 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  31.54 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  30.62 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  30.65 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  31.58 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  33.9 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  30.99 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  32.01 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  29.41 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  32.2 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  31.06 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  31.38 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  29.07 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  31.31 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  32.32 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  36.13 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  31.77 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2774  hypothetical protein  33.97 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  32.73 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  31.58 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  30.87 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  32.73 
 
 		 317 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  32.71 
 
 		 322 aa  139  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  30.87 
 
 		 323 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  31.17 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  31.53 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  32.04 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  34.04 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  30.19 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  31.02 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  30.84 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  35.27 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  29.56 
 
 		 350 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  29.14 
 
 		 332 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  33.89 
 
 		 339 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>