More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0715 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  662    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  83.78 
 
 		 328 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  83.45 
 
 		 328 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3390  hypothetical protein  84.12 
 
 		 330 aa  478  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254723  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2763  hypothetical protein  65.44 
 
 		 322 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  0.0763345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  67.89 
 
 		 323 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  65.09 
 
 		 322 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  65.19 
 
 		 328 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  62.16 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  46.58 
 
 		 337 aa  292  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  48.04 
 
 		 325 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  48.03 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.99 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.99 
 
 		 330 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4169  hypothetical protein  44.51 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.18 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  46.06 
 
 		 326 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.89 
 
 		 326 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  48.32 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4707  hypothetical protein  72.53 
 
 		 216 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.836415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  43.03 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.55 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.98 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.15 
 
 		 328 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46.64 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46.64 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.64 
 
 		 328 aa  259  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  45.18 
 
 		 324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  46.08 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44 
 
 		 358 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  45.12 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  42.55 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  43.49 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0449  hypothetical protein  42.52 
 
 		 327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203149  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.3 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  42.51 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  45.48 
 
 		 304 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  45.12 
 
 		 328 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.25 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  44.11 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.61 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  44.93 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.9 
 
 		 318 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.04 
 
 		 325 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0180  hypothetical protein  43.43 
 
 		 327 aa  245  8e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.55 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.31 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  41.82 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.32 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.62 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.9 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.97 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  43.67 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.57 
 
 		 356 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  42.22 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  42.77 
 
 		 348 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  42.81 
 
 		 323 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.44 
 
 		 324 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  37.04 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3672  hypothetical protein  41.3 
 
 		 327 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.423242  normal  0.0951882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.81 
 
 		 328 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  43.61 
 
 		 337 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.23 
 
 		 328 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  44.78 
 
 		 330 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  40.82 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  42.51 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.81 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  41.25 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4242  extra-cytoplasmic solute receptor  40.32 
 
 		 330 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.289881 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.1 
 
 		 327 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.1 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.18 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  40.87 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  42.41 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.91 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  42.71 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  43.29 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  44.06 
 
 		 334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  41.33 
 
 		 338 aa  235  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  45.12 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.86 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  43.97 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  40.8 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.94 
 
 		 324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  40.69 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  46.6 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.92 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  41.27 
 
 		 341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4844  hypothetical protein  42.15 
 
 		 322 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  41.43 
 
 		 320 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  41.12 
 
 		 329 aa  232  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  41.36 
 
 		 325 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  41.61 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.05 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  41.25 
 
 		 339 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  42.27 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  39.62 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.63 
 
 		 329 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  40 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>