More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5359 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 323 aa  658    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1129  hypothetical protein  58.95 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6308  hypothetical protein  45.45 
 
 		 323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  42.37 
 
 		 321 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  40.62 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  39.69 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1136  hypothetical protein  37.22 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.573559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0430  hypothetical protein  36.42 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0056  hypothetical protein  37.77 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  36.99 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  36.92 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.34 
 
 		 349 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  37.16 
 
 		 328 aa  212  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.97 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.97 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  35.89 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.16 
 
 		 324 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  37.9 
 
 		 321 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4550  hypothetical protein  35.83 
 
 		 331 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.35 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  36.65 
 
 		 328 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.7 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  36.88 
 
 		 334 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  35.85 
 
 		 322 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 		 330 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  36.65 
 
 		 328 aa  205  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.51 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  36.11 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  38.85 
 
 		 308 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  36.84 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  37.25 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  35.76 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.6 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  36.16 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  36.11 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3390  hypothetical protein  38.36 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254723  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  36.24 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  35.47 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  36.45 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  36.86 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  37.04 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  37.06 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  34.48 
 
 		 318 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.26 
 
 		 327 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  35.58 
 
 		 326 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  35.62 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  37.12 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  37.5 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  36.59 
 
 		 346 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  34.78 
 
 		 330 aa  202  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  34.7 
 
 		 336 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  36.22 
 
 		 325 aa  202  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  36.22 
 
 		 325 aa  202  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.02 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.34 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  37.15 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  35.35 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  36.31 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  36.09 
 
 		 351 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  39.2 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  35.62 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  36.31 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  36.73 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  38.18 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.11 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  36.19 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  37.04 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 328 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  34.77 
 
 		 349 aa  198  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  36.91 
 
 		 334 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3859  hypothetical protein  35.45 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16601  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  35.02 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  36.39 
 
 		 386 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  36.67 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  38.16 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  36.28 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  34.8 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.78 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3415  hypothetical protein  36.73 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  37.54 
 
 		 327 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  35.65 
 
 		 333 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  36.22 
 
 		 343 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  36.88 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  36.53 
 
 		 344 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  37.64 
 
 		 329 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  36.96 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  36.63 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  34.76 
 
 		 325 aa  195  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  37.18 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  35.29 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  35.71 
 
 		 328 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  34.88 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.7 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  33.96 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  35.29 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.02 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  37.97 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>