More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3415 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3415  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  651    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3086  hypothetical protein  80 
 
 		 325 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.52 
 
 		 345 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.52 
 
 		 345 aa  245  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  41.55 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  38.97 
 
 		 344 aa  242  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.93 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.41 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  41.47 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.61 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.74 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  39.54 
 
 		 360 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  37.7 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.13 
 
 		 330 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.13 
 
 		 330 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39 
 
 		 330 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.4 
 
 		 327 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.45 
 
 		 330 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  38.03 
 
 		 335 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  41.38 
 
 		 325 aa  231  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.61 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.8 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  39.18 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  39.6 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  41.35 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.13 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  38.21 
 
 		 323 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  39.87 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.27 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.27 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  41.75 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  39.86 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.33 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.75 
 
 		 335 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  36.22 
 
 		 339 aa  225  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1728  hypothetical protein  38.33 
 
 		 324 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000138384  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  41.36 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.8 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  41.36 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  41 
 
 		 332 aa  222  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  39.48 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  38.13 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  38.49 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  37.54 
 
 		 351 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  38.31 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  39.04 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  37.88 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  37.67 
 
 		 331 aa  219  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.94 
 
 		 328 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  37.96 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.98 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  39.02 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  37.79 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.92 
 
 		 328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  38.67 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  39.56 
 
 		 325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  34.75 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  38.02 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  39 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  35.46 
 
 		 325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  39.47 
 
 		 323 aa  215  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  39.88 
 
 		 327 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  36.68 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36.95 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4992  hypothetical protein  40.56 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  36.95 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  37.75 
 
 		 321 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  37.16 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  37.97 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3101  hypothetical protein  37.08 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  38.67 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  36.88 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  37.58 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  36.81 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  38.41 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  40.59 
 
 		 386 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.57 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  37.54 
 
 		 326 aa  212  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.29 
 
 		 304 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  35.94 
 
 		 356 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  35.58 
 
 		 325 aa  212  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  37.25 
 
 		 322 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  36.72 
 
 		 325 aa  212  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  34.56 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  38.67 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  38.67 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  36.75 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  37.79 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  37.54 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  36.02 
 
 		 329 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  35.8 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  37.84 
 
 		 343 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.94 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  36.75 
 
 		 335 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  36.03 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37.31 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>