More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5400 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  89.56 
 
 		 328 aa  560  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2763  hypothetical protein  73.4 
 
 		 322 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  0.0763345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  75.42 
 
 		 323 aa  447  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  69.26 
 
 		 328 aa  411  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  68.92 
 
 		 328 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3390  hypothetical protein  69.8 
 
 		 330 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254723  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  68.01 
 
 		 327 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  60.81 
 
 		 308 aa  348  7e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  48.51 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  50.84 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  47.32 
 
 		 325 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  47.21 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  49.83 
 
 		 339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  48.31 
 
 		 330 aa  275  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  47.1 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  47.95 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4169  hypothetical protein  47.14 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  49.34 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  47.71 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  47.32 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.81 
 
 		 333 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  45.02 
 
 		 328 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.9 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  46.42 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.81 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.36 
 
 		 330 aa  255  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.36 
 
 		 330 aa  255  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  40.75 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  44.75 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.51 
 
 		 335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  39.25 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3672  hypothetical protein  42.17 
 
 		 327 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.423242  normal  0.0951882 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.83 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4707  hypothetical protein  65.24 
 
 		 216 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.836415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0180  hypothetical protein  44.63 
 
 		 327 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.48 
 
 		 325 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.81 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.82 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  42.59 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.72 
 
 		 336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  44.44 
 
 		 330 aa  245  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.99 
 
 		 326 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.79 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  47.17 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.74 
 
 		 356 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.67 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.04 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  44.34 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  42.16 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  41.9 
 
 		 344 aa  241  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  43.61 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  42.36 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  37.93 
 
 		 325 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  43.88 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.88 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.73 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  41.3 
 
 		 321 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.73 
 
 		 327 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  41.61 
 
 		 338 aa  238  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  41.28 
 
 		 335 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.91 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  43.43 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  43.56 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  44.22 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0449  hypothetical protein  41.61 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203149  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  43.81 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  42.62 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  43.18 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.32 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  40.19 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  42.17 
 
 		 341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  43.38 
 
 		 304 aa  235  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.43 
 
 		 324 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  39.26 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.37 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  41.47 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  42.81 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.95 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.03 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  40.45 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  41.61 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  41.75 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  42.14 
 
 		 322 aa  232  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.76 
 
 		 335 aa  231  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  40 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  39.93 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  42.09 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.81 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  43.1 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  41.16 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40.92 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  38.94 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  41.69 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  38.72 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.19 
 
 		 339 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  40.33 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  40.25 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.57 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>