More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0180 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0180  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  657    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  79 
 
 
322 aa  508  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3672  hypothetical protein  63.91 
 
 
327 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.423242  normal  0.0951882 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  51.67 
 
 
326 aa  332  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  51.18 
 
 
327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  51.52 
 
 
337 aa  309  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  48.04 
 
 
325 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.75 
 
 
339 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  43.96 
 
 
322 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.57 
 
 
330 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  40 
 
 
324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.23 
 
 
330 aa  241  9e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  39.63 
 
 
329 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.38 
 
 
356 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  42.42 
 
 
328 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.52 
 
 
328 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  44.11 
 
 
328 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  43.43 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  41.42 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.03 
 
 
330 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.46 
 
 
327 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  39.8 
 
 
324 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  43.73 
 
 
328 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 
358 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  40.53 
 
 
323 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  39.43 
 
 
324 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  41.47 
 
 
329 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  39.56 
 
 
322 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4169  hypothetical protein  38.69 
 
 
319 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  41.03 
 
 
339 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.77 
 
 
324 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.35 
 
 
326 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.56 
 
 
332 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2763  hypothetical protein  38.08 
 
 
322 aa  227  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  0.0763345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  39.12 
 
 
324 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  40.88 
 
 
338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  39.94 
 
 
334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.74 
 
 
336 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.26 
 
 
331 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  38.65 
 
 
335 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  38.87 
 
 
339 aa  222  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.73 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3390  hypothetical protein  43.19 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254723  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.74 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.33 
 
 
324 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.39 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.18 
 
 
335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40.73 
 
 
323 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  40.07 
 
 
325 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  39.53 
 
 
353 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  40.07 
 
 
331 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.71 
 
 
325 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  39.94 
 
 
341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0449  hypothetical protein  33.94 
 
 
327 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203149  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.19 
 
 
328 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0494  hypothetical protein  39.53 
 
 
312 aa  215  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  39.47 
 
 
325 aa  215  9e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  36.92 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.82 
 
 
327 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  37.38 
 
 
320 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  38.51 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  39.2 
 
 
328 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  40.26 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.11 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  38.97 
 
 
331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  38.72 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6030  hypothetical protein  41.28 
 
 
351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.053883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.48 
 
 
323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  39.53 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  34.8 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.8 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  38.11 
 
 
312 aa  212  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  36.91 
 
 
320 aa  212  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  37.42 
 
 
328 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  39.39 
 
 
322 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  36.17 
 
 
324 aa  212  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  37.37 
 
 
326 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3883  hypothetical protein  40.45 
 
 
328 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0436516  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1653  hypothetical protein  39.43 
 
 
333 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.386513  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.6 
 
 
328 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3156  hypothetical protein  40.45 
 
 
328 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.368147  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5491  extra-cytoplasmic solute receptor  38.39 
 
 
321 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  37.78 
 
 
344 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  39.33 
 
 
333 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.04 
 
 
328 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  37.84 
 
 
339 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.16 
 
 
322 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  36.66 
 
 
326 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  37.46 
 
 
324 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.79 
 
 
330 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  37.26 
 
 
324 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.79 
 
 
330 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  40.07 
 
 
308 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  40.07 
 
 
360 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.88 
 
 
325 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  37.54 
 
 
386 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  39.38 
 
 
334 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  38.34 
 
 
341 aa  208  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  39.67 
 
 
325 aa  209  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  38.39 
 
 
325 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>