More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5356 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 321 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  60.94 
 
 		 326 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  56.07 
 
 		 328 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  47.19 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4550  hypothetical protein  44.48 
 
 		 331 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  42.37 
 
 		 323 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0056  hypothetical protein  39.5 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1136  hypothetical protein  38.89 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.573559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0430  hypothetical protein  41.64 
 
 		 349 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  45.61 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  40.56 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3859  hypothetical protein  43 
 
 		 328 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16601  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  44.26 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  39.63 
 
 		 344 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2763  hypothetical protein  42 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  0.0763345 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  39.8 
 
 		 325 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  41.3 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  40.69 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.56 
 
 		 318 aa  221  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1129  hypothetical protein  41.67 
 
 		 327 aa  221  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  42.09 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  40.2 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  41.61 
 
 		 327 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1024  hypothetical protein  38.1 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  38.21 
 
 		 332 aa  215  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  38.65 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  42.23 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  39.39 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  37.37 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  41.53 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  41.89 
 
 		 328 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  39.62 
 
 		 348 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  38.22 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6308  hypothetical protein  35.56 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.05 
 
 		 328 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  41.1 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  39.75 
 
 		 322 aa  208  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  39.87 
 
 		 331 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  39.09 
 
 		 326 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  40.75 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  35.42 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  43.44 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  39.87 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  40.91 
 
 		 337 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  39.33 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.94 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  37.62 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  39.47 
 
 		 329 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.08 
 
 		 332 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1674  hypothetical protein  36.16 
 
 		 326 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  36.64 
 
 		 339 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0277  hypothetical protein  35.69 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4265  hypothetical protein  38 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  37.42 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  39.69 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  39.67 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.88 
 
 		 328 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  34.26 
 
 		 325 aa  202  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5949  hypothetical protein  41.6 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011365  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.62 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.44 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.62 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  40.36 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4223  extra-cytoplasmic solute receptor  36.96 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0796335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.07 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.36 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  38.39 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  36.99 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  38.31 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  36.2 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  35.74 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.7 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.04 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  41.47 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  37.5 
 
 		 349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.49 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  37.07 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.08 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.68 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  38.01 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  41.6 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  35.51 
 
 		 346 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  34.78 
 
 		 322 aa  198  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2941  hypothetical protein  39.46 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  38.97 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  37.54 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.2 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4135  hypothetical protein  38.05 
 
 		 336 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118225  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  37.07 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1257  hypothetical protein  35.76 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  41.16 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  37.33 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  38.01 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  37.74 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  37.99 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2406  hypothetical protein  39.07 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.049669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  38 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  40.15 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  36.68 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>