More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2941 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2941  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  599  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3859  hypothetical protein  57.86 
 
 		 328 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16601  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  42.52 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4550  hypothetical protein  38.93 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  39.46 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  36.49 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  38.44 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  37.5 
 
 		 325 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  38.28 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  37.5 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.29 
 
 		 314 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  41.16 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  39.6 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  36.75 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.93 
 
 		 335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  38.61 
 
 		 324 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  39.74 
 
 		 337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  35.12 
 
 		 323 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37 
 
 		 325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.93 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  40.48 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  37.21 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  38.59 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  38.44 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  35.79 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  37.33 
 
 		 327 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.59 
 
 		 333 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  37.25 
 
 		 327 aa  195  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  38.8 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  37.71 
 
 		 325 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  35.1 
 
 		 332 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  37.54 
 
 		 323 aa  192  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  34.23 
 
 		 338 aa  191  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  37.5 
 
 		 323 aa  191  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  32.69 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  34.78 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  38.18 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  39 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  39.67 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  38.18 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  34.22 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  38.52 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  34.67 
 
 		 328 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  37.5 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  36.45 
 
 		 340 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  36.27 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  36.36 
 
 		 332 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  38.54 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  37.75 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  36.24 
 
 		 323 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  34.45 
 
 		 325 aa  188  9e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.57 
 
 		 337 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36.03 
 
 		 327 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  36.03 
 
 		 325 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  36.67 
 
 		 332 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  34.32 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  36.21 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  32.25 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0709  hypothetical protein  35.1 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  36.18 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  34.55 
 
 		 327 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  33.11 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  35.76 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  36.21 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  33.22 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  36.39 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1024  hypothetical protein  34.8 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  35.59 
 
 		 331 aa  185  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  37 
 
 		 339 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  34.87 
 
 		 332 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.43 
 
 		 328 aa  185  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  35.35 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  36.24 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  35.12 
 
 		 333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  35.64 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  36.24 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  35.12 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  33.77 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  37.95 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  35.67 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  35.33 
 
 		 320 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  34.24 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1866  hypothetical protein  37.5 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  36.08 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  34.8 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2507  hypothetical protein  35.88 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00246181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0056  hypothetical protein  35.14 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  35.23 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  36.63 
 
 		 329 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4432  hypothetical protein  38.41 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  36.7 
 
 		 349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  34.65 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  37.59 
 
 		 322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  37.75 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  33.45 
 
 		 345 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  34.24 
 
 		 335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5175  hypothetical protein  38.46 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573585  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  35.12 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  35.45 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.55 
 
 		 327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>