More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3859 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3859  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  663    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16601  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2941  hypothetical protein  57.86 
 
 		 300 aa  352  5e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  43.12 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4550  hypothetical protein  42.09 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  42.41 
 
 		 321 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  39.32 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  37.3 
 
 		 328 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  38.6 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  38.82 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  38.18 
 
 		 325 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.05 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  39.19 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  38.41 
 
 		 327 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  37.5 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  37.71 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  34.76 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  38.1 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  38.18 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  38.18 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3390  hypothetical protein  38.51 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254723  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  36.36 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37.42 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  38.82 
 
 		 322 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.34 
 
 		 318 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  38.14 
 
 		 323 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  35.26 
 
 		 323 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  36.03 
 
 		 328 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  35.95 
 
 		 328 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  38.33 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  35.11 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  37.62 
 
 		 353 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  35.28 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  37.7 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  41.03 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  34.47 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  38.13 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  37.12 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  38.33 
 
 		 349 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  36.12 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  35.45 
 
 		 325 aa  198  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  37.46 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  35.8 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  35.91 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  34.73 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  38.15 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  39 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0056  hypothetical protein  35.06 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  35.59 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  38.61 
 
 		 337 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1598  hypothetical protein  36.7 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  37.04 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  40.21 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  35.2 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  34.01 
 
 		 330 aa  196  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  33.9 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2144  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  37.15 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  37.38 
 
 		 327 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  37.85 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4265  hypothetical protein  35.98 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0164  hypothetical protein  37.71 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  36.19 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  38.33 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  38.87 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  36.12 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  35.37 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  36.12 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  39.93 
 
 		 326 aa  192  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  35.23 
 
 		 331 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.65 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  35.28 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  36.45 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  34.28 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  35.02 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  35.35 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  32.73 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  34.05 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4223  extra-cytoplasmic solute receptor  34.11 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0796335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  36.49 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  33.94 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  35.52 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.62 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  38.49 
 
 		 322 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1136  hypothetical protein  33.96 
 
 		 332 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.573559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  189  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  34.29 
 
 		 325 aa  189  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  189  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  36.21 
 
 		 338 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  38.6 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  36.14 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  34.69 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4242  extra-cytoplasmic solute receptor  33.11 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.289881 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  35.94 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  36.39 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4640  hypothetical protein  35.53 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  36.61 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  35.4 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4449  extra-cytoplasmic solute receptor  35.24 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  0.159319 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  33.22 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  34 
 
 		 329 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>