More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4550 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4550  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  53.78 
 
 		 323 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  44.71 
 
 		 328 aa  291  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  47.57 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  43.83 
 
 		 321 aa  282  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3859  hypothetical protein  42.09 
 
 		 328 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16601  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0056  hypothetical protein  37.16 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.8 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  39.62 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  39.34 
 
 		 337 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  38.82 
 
 		 326 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2941  hypothetical protein  38.93 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  35.42 
 
 		 325 aa  212  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  38.54 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  35.83 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  36.69 
 
 		 344 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5677  hypothetical protein  37.03 
 
 		 323 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  38.69 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  36.91 
 
 		 322 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1136  hypothetical protein  36.97 
 
 		 332 aa  205  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.573559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  36.18 
 
 		 325 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  35.29 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  38.64 
 
 		 323 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  39.53 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.85 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.93 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  39.05 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.78 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.79 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  35.98 
 
 		 358 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  37.14 
 
 		 328 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  37.79 
 
 		 324 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.83 
 
 		 327 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1395  hypothetical protein  37.25 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.107231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.21 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  37.29 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  36.14 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  36.18 
 
 		 339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  37.01 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  35.85 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  37.84 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  37.35 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  40.68 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  37.2 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  35.97 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  37.62 
 
 		 326 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.67 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  37.84 
 
 		 317 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  35.67 
 
 		 332 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  35.57 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  36.83 
 
 		 321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  36.54 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  37.66 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  37.35 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.76 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  35.19 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  38.49 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.76 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.22 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  39.58 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1024  hypothetical protein  32.21 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0430  hypothetical protein  34.47 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  35.97 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  37.72 
 
 		 352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  35.09 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  34.77 
 
 		 339 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  36.43 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  35.33 
 
 		 325 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  37.42 
 
 		 330 aa  195  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.94 
 
 		 324 aa  195  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  37.84 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  35.38 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.72 
 
 		 335 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  41.2 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  36.69 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  39.29 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  35.37 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  34.98 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  36.4 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  35.28 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3672  hypothetical protein  33.11 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.423242  normal  0.0951882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  39.09 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  36.03 
 
 		 323 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  35.79 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  33.54 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  35.79 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  36.17 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  33.23 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.51 
 
 		 330 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  37.16 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0180  hypothetical protein  35.25 
 
 		 327 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  35.8 
 
 		 361 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  38.43 
 
 		 326 aa  192  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  37.5 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  35.65 
 
 		 330 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.34 
 
 		 332 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  36.24 
 
 		 344 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  32.82 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4265  hypothetical protein  36.45 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  36.52 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>