More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0056 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0056  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  660    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1136  hypothetical protein  44.33 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.573559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  40.98 
 
 		 326 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  40.24 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1575  hypothetical protein  61.29 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  39.27 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  39.5 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.33 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4550  hypothetical protein  37.16 
 
 		 331 aa  225  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  37.77 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.41 
 
 		 325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  37.87 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  38.28 
 
 		 330 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.79 
 
 		 339 aa  219  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2763  hypothetical protein  39.26 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  0.0763345 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.89 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.08 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  38.87 
 
 		 338 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  40.94 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  36.14 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.92 
 
 		 328 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  38.89 
 
 		 327 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  36.73 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  37.46 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5251  hypothetical protein  37.63 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  39.69 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.18 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.72 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  37.58 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  38.53 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.51 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6308  hypothetical protein  36.08 
 
 		 323 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  37.73 
 
 		 326 aa  208  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  36.45 
 
 		 325 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  38.76 
 
 		 322 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  36.88 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  36.28 
 
 		 325 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  36.22 
 
 		 324 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  36.69 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  37.46 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.16 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  38.04 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  37 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  36.25 
 
 		 329 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  36.5 
 
 		 326 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  37.5 
 
 		 327 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  36.73 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.87 
 
 		 325 aa  202  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  37.42 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.87 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  37 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  37.11 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1911  hypothetical protein  37.54 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248685  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  38.1 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  36.48 
 
 		 330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3390  hypothetical protein  39.46 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254723  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  38.67 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  34.55 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1129  hypothetical protein  40.18 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  37.46 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  34.98 
 
 		 346 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  36.39 
 
 		 329 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  35.2 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  33.79 
 
 		 334 aa  199  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  37.97 
 
 		 326 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  36.45 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  36.03 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  37.07 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  37.21 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  37.46 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  37.17 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  37 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  36.05 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  37.54 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  36.56 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  34.81 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  38.41 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  35.65 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  37.46 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1368  hypothetical protein  35.29 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.391308  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  34.11 
 
 		 327 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  35.67 
 
 		 325 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  36.51 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  36.16 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  36.9 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  38.01 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  32.76 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  39.3 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  38.69 
 
 		 352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  37.31 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  37.05 
 
 		 332 aa  196  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  38.51 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  38.59 
 
 		 334 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  35.71 
 
 		 327 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  35.89 
 
 		 335 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.05 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  37.04 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  32.92 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  36.3 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  37.63 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>