More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1136 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1136  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  677    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.573559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0056  hypothetical protein  44.33 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  41.56 
 
 		 323 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  39.44 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  38.32 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  38.89 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  37.22 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  39.66 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  39.25 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  38.8 
 
 		 323 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  35.76 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  36.52 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4550  hypothetical protein  38.08 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1575  hypothetical protein  52.25 
 
 		 228 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  36.15 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3390  hypothetical protein  38.26 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254723  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  35.28 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2763  hypothetical protein  35 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  0.0763345 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6308  hypothetical protein  35.31 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.63 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  33.77 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  35.1 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  32.92 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  37.12 
 
 		 327 aa  192  9e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  33.67 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  36.08 
 
 		 330 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  33.22 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  36.08 
 
 		 330 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  34.01 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  35.84 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  35.49 
 
 		 327 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  34.06 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  36.09 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  35.14 
 
 		 326 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3859  hypothetical protein  34.13 
 
 		 328 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16601  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  33.75 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  35.47 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  34.77 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  34.06 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  33.75 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  34.81 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  33.22 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1129  hypothetical protein  37.15 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  32.33 
 
 		 333 aa  185  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  33.67 
 
 		 326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  35 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  37.54 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  34.08 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  33.56 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  34.88 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  33.11 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  33.11 
 
 		 327 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  34.64 
 
 		 324 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  33.78 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  33.44 
 
 		 334 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  33.89 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  34.23 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  32.79 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  34.32 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  33.66 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  33.96 
 
 		 332 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  35.15 
 
 		 335 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  35.99 
 
 		 332 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  35.83 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  33.44 
 
 		 318 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  32.33 
 
 		 328 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  34.67 
 
 		 326 aa  179  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0430  hypothetical protein  30.74 
 
 		 349 aa  178  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  34.12 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  32.32 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  33.44 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  35.35 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  33.11 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  33.45 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  32.81 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  30.56 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  32.72 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  35.47 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  35.12 
 
 		 335 aa  176  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  31.42 
 
 		 338 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2501  hypothetical protein  36.77 
 
 		 322 aa  175  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  31.19 
 
 		 327 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  33.89 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  34.45 
 
 		 330 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  34.78 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  32 
 
 		 346 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  33.44 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  32.47 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  34.08 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  35.03 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  33.98 
 
 		 334 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  31.87 
 
 		 334 aa  173  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  34.76 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  37.87 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  32.92 
 
 		 326 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  31 
 
 		 328 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  34.11 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  35.91 
 
 		 329 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  32.99 
 
 		 330 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  33.9 
 
 		 339 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>