More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3697 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  676    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  65.44 
 
 		 331 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5386  hypothetical protein  56.12 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.48 
 
 		 349 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  42.59 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.37 
 
 		 327 aa  248  9e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.76 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.56 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.76 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.88 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.21 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  43.58 
 
 		 326 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.2 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  43.92 
 
 		 332 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.16 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.16 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  42.86 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.52 
 
 		 328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.98 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.42 
 
 		 345 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.42 
 
 		 345 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.2 
 
 		 325 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.89 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  41.18 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.47 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  41.69 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.91 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  42.71 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  41.69 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  43.34 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.21 
 
 		 335 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.68 
 
 		 327 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.84 
 
 		 324 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.93 
 
 		 344 aa  235  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  44.11 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.39 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  40.99 
 
 		 332 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  41.35 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  42.52 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4432  hypothetical protein  43.28 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  41.89 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.03 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  42.41 
 
 		 323 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  43.2 
 
 		 334 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  41.01 
 
 		 341 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40 
 
 		 322 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  41.64 
 
 		 325 aa  231  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  43.32 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.39 
 
 		 333 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  41.82 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0911  hypothetical protein  42.52 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  39.43 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  39.93 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.52 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  39.73 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.16 
 
 		 356 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.82 
 
 		 328 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  38.1 
 
 		 332 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.23 
 
 		 328 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.39 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.31 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  39.02 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  42.95 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39.86 
 
 		 338 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  41.83 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  41.21 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  38.51 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  40.13 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.98 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  42.71 
 
 		 334 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  39.8 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.18 
 
 		 336 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  38.51 
 
 		 336 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  41.16 
 
 		 333 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  41.23 
 
 		 325 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  40.21 
 
 		 334 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  38.57 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  41.9 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  39.14 
 
 		 323 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  41.22 
 
 		 329 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  40.27 
 
 		 327 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  40.59 
 
 		 325 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  40.88 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  40 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  37.42 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  38.75 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  39.66 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  38.05 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  41.08 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.12 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  39.08 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  40.48 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.01 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  41.16 
 
 		 326 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  42.07 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  38.58 
 
 		 339 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  39.58 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  39.93 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  38.7 
 
 		 320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>