More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6308 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6308  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  660    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  45.45 
 
 		 323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1129  hypothetical protein  44.93 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  35.99 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  35.56 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0056  hypothetical protein  36.08 
 
 		 328 aa  208  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  38.18 
 
 		 328 aa  208  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0430  hypothetical protein  38.75 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  37.84 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  35.2 
 
 		 346 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  36.03 
 
 		 328 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  35.58 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1136  hypothetical protein  35.31 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.573559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  37.07 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  34.91 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3390  hypothetical protein  37.12 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254723  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  34.19 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  37 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  38.61 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  32.89 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  32.53 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3859  hypothetical protein  33.45 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16601  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  34.34 
 
 		 326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  34.81 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  33.12 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  34.9 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  34.01 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.51 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  35.69 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  34.53 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4550  hypothetical protein  30.41 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  32.9 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  32.92 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  33.86 
 
 		 344 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  35.8 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  34.49 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  34.69 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  31.79 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  34.28 
 
 		 322 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  36.07 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  32.43 
 
 		 334 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  35.59 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  30.53 
 
 		 328 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  34.35 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  38.04 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  36.79 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  35.11 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0101  hypothetical protein  40.18 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.344081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  34.19 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  31.53 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  39.15 
 
 		 330 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  30.82 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  33 
 
 		 323 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  34.56 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5949  hypothetical protein  36.11 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011365  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0118  hypothetical protein  39.73 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  34.95 
 
 		 319 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4309  hypothetical protein  34.77 
 
 		 336 aa  176  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  33.22 
 
 		 325 aa  176  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  34.59 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  36.49 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  33.75 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  31.96 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  34.24 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.64 
 
 		 349 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  32.18 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  33.12 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  33.96 
 
 		 332 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  35.93 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  33.96 
 
 		 327 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  35.08 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  32.05 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  33.56 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  31.55 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  34.35 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  34.6 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  36.67 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.83 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  35.04 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  34.17 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  32.88 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  35.66 
 
 		 328 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  29.77 
 
 		 323 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2774  hypothetical protein  31.78 
 
 		 333 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  33.22 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  35.36 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  33.22 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  32.31 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  33.44 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  169  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  33.67 
 
 		 340 aa  169  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  32.19 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  32.99 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  35.25 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  34.14 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  33.9 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  29.24 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  36.26 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>