More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4551 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4550  hypothetical protein  57.09 
 
 		 331 aa  360  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  48.23 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  44.2 
 
 		 328 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  47.19 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1136  hypothetical protein  41.56 
 
 		 332 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.573559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0056  hypothetical protein  39.27 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  39.69 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.2 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.39 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  40.67 
 
 		 326 aa  225  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3859  hypothetical protein  39.19 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16601  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.84 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  38.12 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  37.63 
 
 		 339 aa  222  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  41.01 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  40.14 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.41 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  37.82 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  38.05 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.83 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.54 
 
 		 330 aa  215  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.54 
 
 		 330 aa  215  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  38.69 
 
 		 343 aa  215  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.14 
 
 		 358 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  39.67 
 
 		 324 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  38.59 
 
 		 338 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.86 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  36.74 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  38.82 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  39.13 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.24 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.51 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.08 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.08 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  38.28 
 
 		 337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.13 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  37.79 
 
 		 333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.64 
 
 		 330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.24 
 
 		 333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  38.26 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.9 
 
 		 328 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  36.09 
 
 		 349 aa  212  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  40.32 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.91 
 
 		 330 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.91 
 
 		 330 aa  211  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  38.64 
 
 		 327 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  38.26 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  38.26 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  35.87 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.81 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  38.51 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40.15 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  37.23 
 
 		 335 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  36.52 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  39.6 
 
 		 337 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0430  hypothetical protein  36.39 
 
 		 349 aa  209  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.78 
 
 		 332 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.09 
 
 		 324 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  35.83 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.2 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  40.56 
 
 		 322 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6149  extra-cytoplasmic solute receptor protein Bug family  37.25 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.873662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  35.83 
 
 		 321 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  36.73 
 
 		 337 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  39.19 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  36.73 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  35.49 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  35.25 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  36.91 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  37.34 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.12 
 
 		 339 aa  206  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  37.22 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  35.48 
 
 		 348 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4101  extra-cytoplasmic solute receptor  36.53 
 
 		 328 aa  205  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0889008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  35.8 
 
 		 328 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  35.56 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  36.67 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  36.68 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  41.75 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  36.77 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37.97 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.51 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  37.74 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  35.26 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  37.5 
 
 		 325 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  38.01 
 
 		 341 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.15 
 
 		 327 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  38.82 
 
 		 344 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  36.13 
 
 		 314 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  36.45 
 
 		 314 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  35.76 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1674  hypothetical protein  36.81 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  42.05 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  36.39 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  36.79 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  37.35 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4640  hypothetical protein  39.34 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  36.96 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  37.19 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>