More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4640 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4640  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  634    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4223  extra-cytoplasmic solute receptor  68.11 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0796335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  41.89 
 
 		 325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  41.39 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  39.45 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  41.5 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  39.73 
 
 		 337 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.27 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.92 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4169  hypothetical protein  37.79 
 
 		 319 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.74 
 
 		 331 aa  201  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  39.34 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  36.16 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  35.79 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3672  hypothetical protein  38.64 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.423242  normal  0.0951882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  35.95 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  36.36 
 
 		 328 aa  199  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.49 
 
 		 330 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  37.79 
 
 		 326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  35.89 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.91 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  37.79 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  36.96 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  37.46 
 
 		 328 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  38.11 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  36.96 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  39.93 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  36.63 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  37.68 
 
 		 334 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  39.46 
 
 		 324 aa  192  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  37.15 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  36.71 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  36.31 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  38 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.99 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  38.05 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  38.17 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.99 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  35.97 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  37.46 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  39.86 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  39.86 
 
 		 328 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  39.86 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  36.58 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  34.67 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  38.75 
 
 		 325 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  37.38 
 
 		 322 aa  188  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  38.81 
 
 		 386 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.25 
 
 		 324 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0180  hypothetical protein  38.18 
 
 		 327 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  36.88 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.15 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  38.44 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  35.02 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  38.03 
 
 		 339 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  35.55 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  36.24 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  37 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  38.84 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  35.14 
 
 		 358 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  36.73 
 
 		 335 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  36.48 
 
 		 335 aa  185  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  35.97 
 
 		 322 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.46 
 
 		 333 aa  185  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  35.16 
 
 		 328 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  37.66 
 
 		 328 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  36.76 
 
 		 321 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  36.01 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  38.11 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3859  hypothetical protein  35.57 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16601  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  36.28 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  34.55 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  36 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  37.42 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  36.48 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.65 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  36.61 
 
 		 353 aa  184  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  35.94 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0709  hypothetical protein  38.32 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  34.27 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2763  hypothetical protein  36.36 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  0.0763345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  36.21 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  35.12 
 
 		 328 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  35.86 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  36.48 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  34.78 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  40.86 
 
 		 330 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  35.42 
 
 		 326 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  36.59 
 
 		 349 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  35.18 
 
 		 331 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  36.27 
 
 		 328 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5716  hypothetical protein  36.01 
 
 		 334 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  38.28 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  33.89 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  35.37 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  36.18 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  35.91 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  35.17 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  33.67 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  35.29 
 
 		 326 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>