More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1198 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0180  hypothetical protein  81.69 
 
 		 327 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3672  hypothetical protein  65.58 
 
 		 327 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.423242  normal  0.0951882 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  50.93 
 
 		 326 aa  332  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  51.47 
 
 		 327 aa  328  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  50.33 
 
 		 337 aa  316  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  47.9 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.1 
 
 		 356 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  40.72 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  44.44 
 
 		 328 aa  245  9e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.57 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  44.44 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.42 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.37 
 
 		 339 aa  242  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  42.59 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.73 
 
 		 358 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.72 
 
 		 329 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  42.19 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2763  hypothetical protein  39.33 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  0.0763345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  42.81 
 
 		 327 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.47 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  42.42 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3390  hypothetical protein  45.79 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254723  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  41.18 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.78 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  38.63 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.34 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.7 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.15 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.05 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  38.82 
 
 		 331 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  38.26 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39.19 
 
 		 338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  37.92 
 
 		 324 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  42.28 
 
 		 308 aa  225  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.66 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.28 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.72 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  37.89 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1653  hypothetical protein  40.84 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.386513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  37.81 
 
 		 334 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  42.28 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  37.87 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  37.97 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  39.27 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  40.71 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  40.81 
 
 		 333 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4169  hypothetical protein  35.65 
 
 		 319 aa  219  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.76 
 
 		 336 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  37.19 
 
 		 322 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  40.39 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4844  hypothetical protein  40 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  39.88 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  39.13 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  38.01 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.67 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  35.71 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  39.06 
 
 		 353 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  38.99 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  39.53 
 
 		 325 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  39.73 
 
 		 323 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  38.29 
 
 		 328 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6030  hypothetical protein  40.67 
 
 		 351 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.053883  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.69 
 
 		 328 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5869  extra-cytoplasmic solute receptor  39.73 
 
 		 346 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0267  hypothetical protein  39.06 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  38.32 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.34 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  36.51 
 
 		 324 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  38.93 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  35.65 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  38.39 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  37.7 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  38.72 
 
 		 328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  39.62 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  37.79 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.44 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  36.58 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  37.46 
 
 		 329 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  34.27 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  39.32 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  40.54 
 
 		 362 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  36.76 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  36.53 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  38.26 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  37.38 
 
 		 332 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  36.63 
 
 		 335 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  36.17 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  39.53 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  37.34 
 
 		 325 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  36.83 
 
 		 310 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  39.01 
 
 		 341 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  36.07 
 
 		 335 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  39.38 
 
 		 334 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  39.56 
 
 		 334 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  38.59 
 
 		 341 aa  209  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  37.41 
 
 		 327 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.67 
 
 		 331 aa  208  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  35.81 
 
 		 329 aa  208  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.18 
 
 		 322 aa  208  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>