More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5882 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 328 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  89.56 
 
 		 322 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2763  hypothetical protein  74.75 
 
 		 322 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  0.0763345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  77.1 
 
 		 323 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  67.91 
 
 		 328 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  67.91 
 
 		 328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  67.68 
 
 		 327 aa  401  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3390  hypothetical protein  67.79 
 
 		 330 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254723  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  60.81 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  47.88 
 
 		 327 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  46.77 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  47.81 
 
 		 337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  49.51 
 
 		 326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4169  hypothetical protein  47.32 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  50.17 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  48.83 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  49.32 
 
 		 330 aa  278  9e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  46.25 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.49 
 
 		 328 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  46.64 
 
 		 324 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  46.31 
 
 		 324 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  42.26 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.34 
 
 		 328 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4707  hypothetical protein  66.84 
 
 		 216 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.836415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.44 
 
 		 318 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.64 
 
 		 327 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.73 
 
 		 349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.25 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3672  hypothetical protein  42.09 
 
 		 327 aa  251  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.423242  normal  0.0951882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.15 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44.15 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.48 
 
 		 327 aa  248  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.16 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.21 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0180  hypothetical protein  42.42 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.85 
 
 		 328 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.5 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.71 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  43.05 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  42.42 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  45.95 
 
 		 335 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  39.31 
 
 		 325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.12 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  44.19 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.07 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  43.93 
 
 		 336 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.68 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  42.42 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  42.06 
 
 		 326 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  43.79 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  40.45 
 
 		 344 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  41.28 
 
 		 335 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  42.99 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.56 
 
 		 328 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  43.25 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.26 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  43.43 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0449  hypothetical protein  41.61 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  41.78 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  41.28 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  41.78 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.8 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.5 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  43.04 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  40.44 
 
 		 348 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  39.63 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.43 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  42.52 
 
 		 334 aa  235  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  41.18 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.47 
 
 		 314 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.71 
 
 		 327 aa  235  9e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  42.31 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.71 
 
 		 325 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  45.87 
 
 		 334 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  42.42 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  43.53 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.37 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  42.09 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  40.6 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.62 
 
 		 333 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  40.12 
 
 		 329 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  40.38 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.61 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.91 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.19 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  41.28 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  40.47 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  41.36 
 
 		 325 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.41 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.28 
 
 		 328 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40.58 
 
 		 322 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  38.08 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  41 
 
 		 322 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  39.41 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.99 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.57 
 
 		 341 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.14 
 
 		 325 aa  229  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  41.14 
 
 		 332 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>