More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4223 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4223  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 317 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0796335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4640  hypothetical protein  66.67 
 
 		 318 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  41.18 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  40.52 
 
 		 337 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  38.93 
 
 		 326 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.67 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  38.46 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.78 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.34 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  39.87 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.07 
 
 		 330 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.44 
 
 		 330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  40.91 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  39.37 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  40.82 
 
 		 327 aa  212  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  39.6 
 
 		 335 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  39.06 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  38.69 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4169  hypothetical protein  35.2 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.4 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  38.69 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  40.21 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  37.78 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3672  hypothetical protein  37.62 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.423242  normal  0.0951882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.97 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  36.71 
 
 		 321 aa  205  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  38.02 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  38.61 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  37.92 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  38.21 
 
 		 335 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.67 
 
 		 328 aa  202  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.28 
 
 		 328 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.67 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  37.71 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.32 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  39.86 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.95 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  36.5 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  39.86 
 
 		 328 aa  199  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  36.15 
 
 		 337 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  35.51 
 
 		 323 aa  198  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  37.93 
 
 		 322 aa  198  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  44.36 
 
 		 322 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  35.31 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.83 
 
 		 331 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  38.89 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  37.3 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.39 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  36.27 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  39.19 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  37.85 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.03 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  36.18 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4242  extra-cytoplasmic solute receptor  35.74 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.289881 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  37.84 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  39.54 
 
 		 328 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  37.97 
 
 		 325 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  37 
 
 		 340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  38.56 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2763  hypothetical protein  37.17 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  0.0763345 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  37.22 
 
 		 351 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  34.17 
 
 		 335 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0180  hypothetical protein  36.95 
 
 		 327 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  38.59 
 
 		 332 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0449  hypothetical protein  34.45 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203149  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  39.53 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  37.58 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  37.22 
 
 		 345 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  35.69 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  37.22 
 
 		 345 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  35.86 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0494  hypothetical protein  36.82 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  36.91 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  41.89 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  38.01 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  36.22 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  35.92 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  36.9 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  36.27 
 
 		 343 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  35.79 
 
 		 324 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  37.8 
 
 		 335 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  38.81 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  38.46 
 
 		 332 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.09 
 
 		 324 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  37.2 
 
 		 320 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.17 
 
 		 332 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  38.03 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3390  hypothetical protein  39.13 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254723  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  34.98 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  38.46 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  37.38 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  36.51 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  35.69 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  35.51 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  38.21 
 
 		 334 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  38.33 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  40.58 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  37.91 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>