More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1672 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  73.31 
 
 		 328 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  60.94 
 
 		 321 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  48.23 
 
 		 323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4550  hypothetical protein  47.65 
 
 		 331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0056  hypothetical protein  40.98 
 
 		 328 aa  255  8e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1136  hypothetical protein  39.44 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.573559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3859  hypothetical protein  43.73 
 
 		 328 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16601  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  40.62 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  44.03 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  38.93 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  42.06 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  43.18 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.44 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0430  hypothetical protein  38.18 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  40.8 
 
 		 325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  38.92 
 
 		 333 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  41.98 
 
 		 328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6308  hypothetical protein  35.99 
 
 		 323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.02 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  40.76 
 
 		 348 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  41.64 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.73 
 
 		 328 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.86 
 
 		 328 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  39.5 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  43.1 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.89 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  37.84 
 
 		 339 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  38.15 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  40.13 
 
 		 326 aa  215  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.96 
 
 		 328 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.8 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.86 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  40.61 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  37.79 
 
 		 332 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  37.58 
 
 		 349 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.54 
 
 		 325 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3390  hypothetical protein  42.03 
 
 		 330 aa  212  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254723  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  39.49 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.11 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.96 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  37.58 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2941  hypothetical protein  42.52 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2763  hypothetical protein  38.78 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  0.0763345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  40.14 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1129  hypothetical protein  42.02 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  39.8 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  40.79 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  40.34 
 
 		 323 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.1 
 
 		 327 aa  208  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  37.42 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0255  hypothetical protein  41.84 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  34.05 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  39.66 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  36.61 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  38.83 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  39.66 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.34 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  36.82 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  39.66 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  38.05 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  35.93 
 
 		 330 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  42.07 
 
 		 352 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  37.58 
 
 		 337 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  35.93 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.26 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1997  hypothetical protein  40.79 
 
 		 334 aa  205  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.02937  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.26 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  42.97 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  38.3 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  37.16 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.48 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.22 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  42.18 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  35.25 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  38.31 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  37.76 
 
 		 339 aa  202  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  34.94 
 
 		 325 aa  202  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  37.58 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  36.36 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  40.2 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.02 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1466  hypothetical protein  40.32 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  37.84 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  37.46 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  38.83 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  37.5 
 
 		 331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  39.46 
 
 		 330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  38.46 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  36.25 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  37.04 
 
 		 329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.61 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  35.45 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  34.58 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  39.22 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  36.84 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  39.13 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  38.83 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  35.15 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>